煙は３０分ほどで消し止められ、安全点検終了後、午前９時３５分に運転が再開された。ＪＲ北海道は、雪が降らずに乾燥した状態になっていた枕木が凍結防止用の電気ヒーターで加熱されたのが原因とみている。
函館線と千歳線は午後０時４５分現在、特急スーパーカムイや快速エアポートなど上下線の計５１本について運休または運休を決めた。
苗穂駅では昨年１２月１３日にも、今回の現場に近いポイント部分で、凍結防止用の電気ヒーターの過熱で枕木から煙が上がるトラブルがあり、１０６本が運休した。
１０日午前８時５０分頃、札幌市中央区北３東１３のＪＲ函館線苗穂駅構内で、下り線を走行中の普通列車の運転士が、上り線のポイント付近の枕木がくすぶっているのを発見し、指令センターに連絡した。