オオシマザクラ→大きくて整った花形
エドヒガン→花が葉より先に咲く

を掛け合わせた

江戸末期から明治初期に、江戸の駒込染井村に集落を作っていた造園師や植木職人達によって育成された

当初はサクラの名所として古来名高く西行法師の和歌にもたびたび詠まれた大和の吉野山にちなんで「吉野」「吉野桜」として売られ、広まった。

1900年上野公園の桜の調査が行われた際、ヤマザクラとは違う品種である事がわかり、この名称では吉野山に多いヤマザクラと混同される恐れがあるため

染井村+吉野(桜の名所)
→ソメイヨシノ
と名付けられた。