• 新二話　エントツ山とメガ隕石

• 新一話　ムゲンの力とメガシンカ

• 新一話　メガシンカと超古代ポケモン

• 第零話　メガシンカポケモンを探して三千里

• 第零話　意思を繋ぐ石を探して

• 番外編　世界は三点で作られている

• 番外編　人間にとってポケモンとは　

• 番外編　人造ポケモンとメガシンカ

• 番外編　アヤツリ人は傷つかない

• 番外編　改造ポケモン

• 番外編　ポリゴンZ争奪戦・GFR

• 番外編　一番二番

• 番外編　良い次元異次元

• 番外編ω　終わりと始まり

• 番外編μ　古代の遺跡

• 番外編α　真ん中　

• 最終話　ラジオ塔襲撃事件の被害者はロケット団である。

• 第九話　怪電波発信　世界滅亡へのカウントダウン

• 第八話　絶対絶命怒りの炎

• 第七話　伝説のポケモン・ホウオウ

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