| 高処理のMALDI-TOF腫瘤配列を使用している乳癌の22の候補遺伝子のメチル化プロフィール 「DNAメチル化パターンの変更は、診断法のための生物マーカーと癌の治療法として示唆された。後成的発現景色のあらゆる新規発見とイベントの正確な分析のための改善されたアプローチのあらゆる開発は、新しい機会を患者の管理に対して提供する可能性がある。マトリックスによって援助されたレーザ脱離/イオン化の上の新規高処理の質量分析を飛行時間型に（MALDI-TOF）扱うことは珪肺症を伴う欠ける、我々は胸部癌組織で22の候補遺伝子の半定量的メチル化変更を決めた。初めて、我々は96の異なるパラフィン包埋組織（48の胸部ガン組織と48の対応のある正常組織）の22の遺伝子の上で、合計42 528のCpGジヌクレオチドのメチル化状態を分析した。双方向階層的なクラスター分析は、メチル化プロフィールを分類するのに用いられた。この研究において、10の過剰メチルアルコールと混合した遺伝子（APC、BIN1、BMP6、BRCA1、CST6、ESRb、GSTP1、P16、P21とTIMP3）は、メチル化の程度まで一致しているガンおよび正常な組織を区別するために確認された。CpGジヌクレオチドにつきメチル化ステータスの個々の評価は、ガン組織標本のシトシン過剰メチル化が大部分は転写因子結合部位の共通配列の近くに位置することを示した。これらの過剰メチルアルコールと混合した遺伝子は臨床分子診断のために生物マーカーの資格で勤める可能性がある、そして、2009年6月8日に、胸部cancer.Oncogeneを有する患者の目標とされた治療はオンライン刊行を前進させる;doi：10.1038/onc.2009.149。」 Methylation profiles of 22 candidate genes in breast cancer using high-throughput MALDI-TOF mass array. Alterations of DNA methylation patterns have been suggested as biomarkers for diagnostics and therapy of cancers . Every novel discovery in the epigenetic landscape and every development of an improved approach for accurate analysis of the events may offer new opportunity for the management of patients . Using a novel high-throughput mass spectrometry on matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) silico-chips, we determined semiquantitative methylation changes of 22 candidate genes in breast cancer tissues . For the first time we analysed the methylation status of a total of 42 528 CpG dinucleotides on 22 genes in 96 different paraffin-embedded tissues (48 breast cancerous tissues and 48 paired normal tissues) . A two-way hierarchical cluster analysis was used to classify methylation profiles . In this study, 10 hypermethylated genes (APC, BIN1, BMP6, BRCA1, CST6, ESRb, GSTP1, P16, P21 and TIMP3) were identified to distinguish between cancerous and normal tissues according to the extent of methylation . Individual assessment of the methylation status for each CpG dinucleotide indicated that cytosine hypermethylation in the cancerous tissue samples was mostly located near the consensus sequences of the transcription factor binding sites . These hypermethylated genes may serve as biomarkers for clinical molecular diagnosis and targeted treatments of patients with breast cancer .Oncogene advance online publication, 8 June 2009; doi:10 .1038/onc .2009 .149 . Reference: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/, PMID:19503099 |