ファイルの内容で比較するフリーソフトの、良さそうなものを探してネット上を見たら
WinMerge 日本語版
DF
テキスト差分表示ツール（TextDiffDsp）
Rekisa
が良さそうだったので、
当ＰＣで使えるものをＤＬしてみた。
※「Rekisa」は、「.NET Framework 1.1」が必要になるので除外したよ
とりあえず、結果を見て編集（＝エディット！）出来なくてもいいので、
見た目で違いが分かりやすそうな「テキスト差分表示ツール（TextDiffDsp）」を
使ってみた。
けっこういいです！
違ってる行ごとに、 削除／追加／変更 の印を表示してくれるのがいいね！
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追記。
少し後で、「差分調整係数」なるものを 特にさわらず！ → 30（＝最大値）に
指定してみたら、途中に100行以上挿入された「かたまり部分」を正しく判定し、
２つのファイルの違いを「的確に」表示してくれたよ！
※どこまで対応できるのか不明だが、やってみる価値はある；データが大量
だと、かなり時間がかかるだろうが。