php.cgiのコピー

とあるレンタルサーバーでphp.cgiを利用している時、

ふつうにFTPでコピーすると内部サーバーエラーになって表示できなかった。

FTPの転送モードでバイナリにするとOK

転送モードが自動判別やテキストだとNG,デフォルトバイナリにしてほしいが、テキストモードだったり、自動判定モードだと、気が付かない内に役にたってたりもするんだろうか？