水素原子のシュレーディンガー方程式の解A，２体問題1 の式(1-3)に、水素原子のシュレーディンガー方程式の解A，２体問題3 の式(A-3-3)を代入します。そして変数分離します。
代入すると波動方程式は次のように求まります。
そして次のようにおいて、この波動方程式を変数分離します。
演算子と無関係な関数をそれぞれ演算子の左に出します。
左から1/FΨを掛けます。
並進運動の項を左辺へ、それ以外を右辺へ移項します。
左辺は (ｘ,ｙ,ｚ)の関数、右辺は(ｒ,θ,φ)の関数、この等式が常に成り立つためには両辺は定数でなければならない。ここでは０とおきます。
左辺より重心(ｘ,ｙ,ｚ)の並進運動の方程式が得られます。
右辺より電子と核の重心を原点においた極座標(ｒ,θ,φ)の電子軌道の波動方程式が得られます。
換算質量μを次のようにおいています。
電子1個と陽子1個のポテンシャルVは、MKSA表示のSI単位系で次のようにおいています。
ε0は真空の誘電率で次のような式で表わされます。
ｃは真空中の光速です。