次のような理由から心は科学の対象外でした。
「『科学的』であるためには、理論的な説明がつくこと、それゆえ『論証性』があること、および、いつでも実証できて、再現できること、それゆえ『実証性』と『再現性』があることの3つの基本的条件が満たされることが必須条件とされてきた。そのため、『論証性』も『実証性』も『再現性』も保証されないような『心の世界』といった曖昧な世界の研究は非科学的であるとして完全に排除ないし捨象されてきた」（岸根卓郎）
しかし、「心の世界といった曖昧な世界を無視してつくられた仮説は現実から乖離するという重大な欠点がある（岸根）」のです。
・人生の根本問題に科学は無力
エジソンは、ある記者に「君は何をしにここへ来たんだ？この地上に」と問いました。
記者が答えられないでいると、エジソンは「ほら、そうだろう。われわれはわかっていない。わからないんだ。わかるには限界がありすぎる。本当に重要なことは、人間にはまだつかめていないんだ」と言ったといいます。
また、サイエンスライターのコンノケンイチは「この世に生きているとは？誰も避けられない死とは？死後の世界は？こうした肝心なことに人類は完全に無力で、現代科学には権威しかない」と言って死んでいきました。
心を対象外にしてしまったことによっていろんな問題が生じてきますが、人間にとって何よりも問題なのが人生の根本的な問題に対して科学が力にならないということでしょう。
・無数の宗教ができてしまった
今日、無数の宗教が乱立しています。
宗教年鑑平成26年版によれば、219,939の宗教団体があり、内訳は次のようになっています。
神道系：88,549（40.2%）
仏教系：85,282（38.7%）
キリスト教系：9,347（4.2%）
諸教：36,761（16.7%）
これらの宗教団体が正しいことを教えていればいいのですが、実態はそうではありません。おかしい宗教で溢れています。
今日、「宗教」という言葉に対するイメージが悪いのも無理からぬことです。宗教とは書いて字の如く、「宗（むね）とする教え」であり、この言葉自体は本来、善でも悪でもないはずです。
なぜこうなったのか、その一因は心が科学の対象外だったことにあるでしょう。
アインシュタインは「科学のない信仰は盲目だ」と言いましたが、このように科学には致命的に頼りない面があるために、科学の力が及ばない心の世界の解決法として無数の宗教がはびこってしまったといっても過言ではありません。
たとえば、先に紹介した通り「祈り」は良い影響を与えますが、このことを知らない人の中には、特定の神や教祖の力だと思ってしまい、「自然治癒力が治し、医者が金を請求する」というような滑稽なことが起こるかもしれません。
あるいは、超能力が使えるというだけで神格化してしまい、その人の言うことを何でも信じてしまうかもしれません。
大門正幸の教え子の1人がオウム真理教の地下鉄サリン事件に絡み逮捕されたといいます。
「彼は、筆者など足元にも及ばないくらい普段から人生を深く真剣に考えている真面目な若者でした。研究室にやってきては、筆者に挑むような熱心さで議論を吹っかけてきました」
「『人生の目的って何ですかね』『人間は何のために生きているんですかね』そんな人生論が中心でした。深い人生論を持ち合わせていなかった筆者は、唯物論的な観点に時折キリスト教的な視点を入れて解答したように記憶しています」
「もし教団のことを少しでも知っていたら別の対応ができてたのではないかと悔やまれます」
そして、なぜ高学歴のエリートといえる人物が信じてしまったか、その結論として「人間を越えた何か聖なるものの存在や、霊体験や神秘体験といった超常現象を、科学的にありえないものとして表舞台から排除してしまったこと」を根本的な原因に挙げています。
カール・セーガンも次のように言います。
「オウム真理教は、教養ある人々をたくさんひきつけ、なかには物理学や工学の高い学位をもつ人たちさえいた。つまりその教義は、無知な大衆向けではないのである。そこには何か別のことが進行しているのだ」
また、石川幹人は「超心理学が進めば、超能力の限界が判明するなど、熱狂的な信奉に歯止めがかかる。超能力はありえないなどとして、放っておくほうがむしろ危険である」と言います。
オウム真理教の信者だった端本悟元死刑囚は、早稲田大学法学部に進学するも、オウムに入信した友人を取り戻そうとするうちに、自ら信仰にのめり込んだといいます。彼の母は次のように悔やんでいます。
「止めて止めて止めたんだけどね。出て行く時は正座して“21年間幸せに育ててくれてありがとう”“でも戦争を止めなきゃ”って。馬鹿みたいな話なんだけど、ああいうところに行くとそうなっちゃうんだろうね。子どもの頃からこういう恐ろしいものがあるんだよって教えられていれば・・・・」
オウムの事件に触れ、京都大学の元総長が「物理学を学ぶ人間が、空中浮遊などというあり得ない現象に騙されたのは残念」と言ったそうですが、この調子ではこれからも止めることはできないでしょう。