韓国任天堂の公式サイトを見たところWi-Fiに関する注意書きみたいなものがありました。その注意書きとは日本版を含む海外への通信に関してで次のようなものです。なお、青字の部分は日本語に翻訳したものです。
Wi-Fi通信
「포켓몬 Wi-Fi 클럽」에서는 「친구 수첩」을 통해 서로 「친구 코드」를 등록한 친구와
통신이 가능하며, 한글판끼리만 Wi-Fi 통신이 가능합니다.
「ポケモンセンターWi-Fiクラブ」では「ともだちてちょう」を通じてお互いに「ともだちコード」を登録した友達と通信ができ、ハングル版同士のみWi-Fi通信ができます。
GTS
「글로벌 트레이드 스테이션」에서는 해외판과도 Wi-Fi 통신이 가능합니다.
GTSでは海外版ともWi-Fi通信ができます。
バトルタワー
배틀타워의 「Wi-Fi 배틀룸」에서는 해외판과도 Wi-Fi 통신이 가능합니다.
バトルタワーにある 「Wi-Fi バトルルーム」では海外版ともWi-Fi通信ができます。
注意書きとこれまでRuliweb.comに寄せられた情報を総合すると次のようなことになります。
韓国（ハングル）版 
日本版、英語版
Wi-Fiクラブでの交換や対戦 ×
GTS ○（日本版、英語版では韓国版から来たポケモンの名前は英語に変換されます）
バトルタワー ○
ユニオンルーム △（お互いが見えません）
海外版の連動に関してはこれで以上みたいだが、マイスターのお気に入りのポケモン図鑑やパルパークといった要素も分かり次第お伝えしたいと思います。
『ポケットモンスター ダイヤモンド・パール』におけるWi-Fi通信やちかつうろについて （韓国任天堂）
【追記】
なすびんちゃ～さんが書き込んだ情報によるとユニオンルームではお互いが見えないことが確認されました。（2008-02-23 18:37）