KsjTool

0. KsjToolを起動中の場合は終了する。
1. KsjToolのインストールフォルダ（デフォルト設定では、"C:\Program Files\KsjTool"）にあるGUI.batを編集モードで開く。
2. 四行目の
　　set option=-Xms256m -Xmx256m
という記述のうち、"256"を二箇所とも"512"に書き換え
　　set option=-Xms512m -Xmx512m
とする。（ただし、PCのメモリが512MB以上であることが前提）
3. GUI.batを上書き保存する

デフォルト設定では、上記「2.」にありますように、使用するメモリを256MBと設定しているため、お使いのPCのメモリが256MBを超えていても、それを最大限使用せずエラーメッセージを表示して終了します。

http://nlftp.mlit.go.jp/ksj/other/faq.html