検疫所は厚生労働省の所管の組織で、全国各地の港湾に設置されています。
ここで、輸入食品の安全性をチェックするのが食品衛生監視員の仕事です。
検疫所と同じく港湾に設置される組織で似たようなものに「動物検疫所」「植物防疫所」「税関」などがありますが、仕事の内容は異なります。動物検疫所と植物防疫所は農林水産省の管轄、税関は財務省の管轄です。
また、都道府県や政令指定都市などの自治体にも食品衛生監視員がいますが、自治体は国産食品（通関後に、国内流通する輸入食品を含む）を担当することになっています。