二世帯住宅って別々の家族が一緒に住むことになる。もともと二世帯であれば問題ないのですが、どちらかの親御さんの敷地をお借りする?そんなイメージでしょうか。
完全分離型であれば、隣に住んでいる感覚です。ただ玄関・お風呂やキッチンが一つの場合は気遣いも・・・


二世帯住宅スタイルはふたつのパターンかと思います。

【完全分離型】※すべて別で建物はひとつ。
ご主人様側の親御さん
なぜならば、奥様は実の母親ではないので、常に気を配らなくてはならないのでは?
なので、同じ建物でも分離型であればプライベートの時間も作りやすいのかと。

【一部共有型】※玄関・お風呂・キッチンは共有
奥様側の親御さん 
なぜならば、奥様は自分の親なので基本的には甘えられる。
ご主人も変に心配しなくても仕事に集中できます!とかとか。

プラン作ることが一番大変かと思いますので言いたい放題、住宅会社へ伝えてまとめてもらうことが一番近道かと思います。
使い勝手や叶えたいことをです。