母方祖父系（Ｙ染色体）の系統

１１月１３日に追加テストが必要なため２～３週間さらにかかるよと表示があった母方の従兄に依頼をして採取したＹ染色体検査の結果が出ていました。１０月１４日にアメリカの検査機関へサンプルが到着し、本日結果が出たということで、実質３３日間で結果が出たということになります。

ハプログループから見たら父方祖父の系統と同じハプログループＯでした。確かに日本人にはＯ系統が多いとは言っても（５０％以上）、父方とは違う系統だったらなにが良いのかわからないけど、良いかなとか思ってたんですが結果としては同じに。

Ｙ－ＤＮＡ検査のジェノグラフィックプロジェクト標準１２マーカーの検査結果を父方と母方で比較してみたのですがマーカー値の差分合計が１４あり同じハプログループＯでもかなり差がある結果が出ました。確かに約６万年前のアダムさんは全人類の先祖ということで言われていますので全ての人類が親戚といえば親戚かもしれませんが、１２マーカーの検査で差分が３あると少なくとも１５世代で関係はなかったということらしいですので、今回の結果から差分が１４あるということは、数千年単位で父方と母方が親戚ではなかったということになると思います。

検査の進捗状況 ②

ナショナルジオグラフィック社の方に出したサンプルは合計４つで、今のところ２つに関しては結果が出ています。残り２つのサンプルについて片方に進捗？？があったようです。本日（２０１１年１１月１３日）で両サンプルともアメリカの検査機関に届いてから３０日目です。

母方の従兄に依頼し採取した母方祖父系のY-DNA検査

DNAの解析は終わったんだけど、初期解析の品質検査段階であなたのDNAから明確にハプログループを知ることができませんでした。そのために追加の検査が必要であと２～３週間必要ですとのこと。

一番最初にサンプルを取り送付した父方のY-DNA検査の時も上記同様に追加検査が必要だったんですよね。その時にはサンプルが先方に届いてから４０日目くらいに上記の画面が出て、最終的に結果が出るまでに５８日かかったので、この画面の通り２～３週間（実際には１８日間）で結果が出ていました。

もう一方の父に依頼して採取した父方の祖母系のmtDNA検査は前回（１１月３日）と変化なく

DNA　ISOLATIONのままでした。mtDNAで先に結果の出た母方祖母の検査時にも今回のようにDNA ISOLATIONに長時間滞留し、いきなり飛んで結果が出ていましたので今回もそんなパターンかなとか思っています。

Family Tree DNAのデータベースによるマッチ

Family　Tree　DNAのサイトに登録をすると他に登録された世界中の人とのDNAマッチングをしてもらえる機能があります。「Ancestral　Origin」という機能を選択することによって表示がされるのですが、とりあえず今日（２０１１年１１月１１日）現在の表示内容です。

Y-DNA　によるマッチング

mtDNA　によるマッチング

まだ遺伝子検査のレベルが両方とも低いレベルによるマッチングなので、おそらくそれほど信じられるレベルではないと思うのですが、Y-DNAのほうはイギリスの方２名（２３９６１名のサンプルの中で）、スイスの方１名（１８１８名のサンプルの中で）と完全にマッチしているらしいです。

またmtDNAのほうは日本の方１３名（３６８名のサンプルの中で）、韓国の方１名（９４名のサンプルの中で）、アメリカの方１名（９１７名のサンプルの中で）と完全にマッチしているらしいです。

どう見ても私自身を含め親戚および家族は日本人の外見をしているのですが、このような結果に・・・・とりあえず遺伝子レベルでみるとやはりかなり希少種？？なのかなと思っています。

追加の検査 ②

先日追加の検査を依頼したFamily Tree DNAという場所でmt DNAの追加検査もできるようでしたのでこちらも追加の検査依頼をしてみました。mt DNAPlusというコースで、ジオグラフィックプロジェクトで解析をしたHVR1の部分にプラスしてHVR2の部分を検査するというものでした。昨日のブログで書いたようにmtDNAには１６５６９個の部屋が基本的にあるようなのですが、この検査で既に検査をしてある

HVR1　－　１６００１～１６５６９の部分だけではなく

HVR２　－　００００１～００５７４の部分を検査してもらえるとのことです。

これによって現時点で入手しているデータよりは若干深い所まで知ることができるのかなと思っています。

この検査は＄６３の追加料金を請求されましたが、クレジットカードの為替レートが＄１＝７９．４５３円だったために、実際の請求金額は５００５円でした。検査結果が出る予定が２０１１年１２月２６日とのことです。

mt DNAからのハプログループ確認方法

人類のmt DNAは各種WEBサイトや本などを調べてみたところ１６５６９個の部屋？があって、そこの中の住人が

A　Adenine　アデニン

T　Thymine　チミン

C　Cytosine　シトシン

G　Guanine　グアニン

これらの４人のタイプの住人で、いろいろな部屋に住んでいるらしいです。英国のケンブリッジ大学に所属していたDr. Fred Sanger氏のグループが１９８１年にCRS（Cambridge Reference Sequence)というmt DNAの配列を定義し、これを基準に各個人のmtDNAとの違いを使用しハプログループを決定してるらしいです。

CRSのHVR1からHVR3の部分を抜粋

現時点で、私のDNAの検査にはHVR1（Hyper　Variable　Region　１）の検査及び比較しか終了していないのですが、その段階でハプログループAであるとの結果が出ています。

ハプログループを細かく分類すると１０００通りを超える数があるようなのですが、検査結果がCRSと違い上記のテーブルに合ったように変異が起こっていればそのハプログループをであると決められるようです。

１６２９０号室はCRSによるとC（シトシン）さんが住んでいるはずなのに、私のmtDNAはT（チミン）さんが住んでおり、１６３１９号室にはG（グアニン）さんではなくA（アデニン）さんが住んでいるということからハプログループAと結果が出ているようです。人によっては部屋が部分的に無い人もいたり、部屋を増やしている人もいたりといろんなタイプのDNAを持った人がいるようです。