Nhm-v2-00の実行手順(preprocessディレクトリを作ったりで、自分仕様になってます。)
*デフォルトにはpreprocessディレクトリなど無し。
簡単なので、沢田さんのマニュアルと併用するのが望ましい。

①Nhm-v2-00/Tools/preprocess/unzip
  wgrib.manal.shでMANALデータを解凍。
  ファイル名など変えるのを忘れずに。
  解凍するデータ(grbファイル)は /mnt/raid2000/manal_data/ 内に格納しておく。
  ⇒解凍されたデータは preprocess/mkinit_manal/manal_data内に出力される。

②preprocess/mkinit/manal_data
  解凍したデータをconnect_manal.shでつなぐ。
  (もちろん、計算する時間分のデータをつなぐこと)
  つながれたデータはconnect_dataディレクトリに出力される。
  ちなみに、つなぐ以前の.Vや.TMP等のファイルは削除されるようにしてある。

③preprocess/mkmedi/script
  中間ファイルの作成。
  readmanal.shを必要に応じて書き換え、実行。
  preprocess/mkmedi/script/medial_dataに出力。

④preprocess/mkinit_manal/script
  初期値・境界値の作成。
  manal2nhm.shを書き換え、実行。
  詳しくは沢田さんのページ参照→http://wind.geophys.tohoku.ac.jp/~sawada/main/node17.html
  できあがったデータは、mkinit_manal/work${size}にディレクトリごと作成される。

  プログラムについて…
  nflmanal2007_sst.f→OISSTのみ使用バージョン
  nflmanal2007_msst.f→OISST,MSST併用バージョン
  どちらを使うかによって、manal2nhm.sh内で指定を変更。

④'地形・SSTの準備(↑で使います)
 
  preprocess/mkinit_mamal/mkorg/ :逐次版バージョン
  preprocess/topo_make/ :新バージョン(?)
  地形の作成。NHM間では互換性があるので、どちらで作ってもオッケー。
  使いやすい方でどうぞ。

  SST置き場はこちら→OISST:/mnt/raid1200/OISST
               MSSTについては新世代海面水温開発グループのサイトからDL

⑤Nhm-v2-00/Parm/Pf/FCST
  パラメータカード(parm_XXXなど)の書き換え。
  沢田さんによるnamelist一覧を参考にしながらがよい。
  計算・出力する要素、パラメタリゼーションの設定、出力間隔等を設定。
  大事なところです。

⑥Nhm-v2-00/Ss/Pf/FCST
  実行シェル(fcst_XXXなど)の書き換え。
  ⇒実行!

*モデルの実行サイズが大きすぎでエラーになる場合は
 ulimit -s unlimited
 とコマンド入力後、実行。メモリ制限を外しての実行。

⑦Nhm-v2-00/Data/Pf/FCST/work_${size}
 モデルのログはここ。
 実行の様子は tail -f log.fcst.XXXX でチェック。

⑧Nhm-v2-00/Tools/postprocess/nhm2grads
 ここで、実行結果をgradsで見れる形に変換する
 n2gr_{SPEC}.shを書き換えて実行。
 (結果が多いほど時間がかかる)
 同じディレクトリ内にgrads~(自分が指定した形)で結果が出る。
 あとはgradsで見るだけ!

⑨Nhm-v2-00/Tools/postprocess/vertical
 Nhmの結果を緯度・経度に沿わない形で切りたいときは、このツールを使う。
 使い方は”経度・緯度によらない鉛直断面”の項を参照。
 ただし、Nhm用のシェルはfig_make_vcs.shである。