ポリフェノールが多くて手強い植物組織からのRNA抽出を行うには? | 難しい材料からのDNA/RNA抽出お悩み解決 SNP解析・PCRも「すいすい」!

難しい材料からのDNA/RNA抽出お悩み解決 SNP解析・PCRも「すいすい」!

「農」に関わるご研究を全力でサポートする、つくばの小さなバイオベンチャー・株式会社リーゾです。
ニッチだけれど切実な、農学関連研究分野のニーズに応え、オリジナルで開発した試薬とサービス「すいすいシリーズ」をご紹介しています。

「RNAすいすい-P」活用法





さまざまな研究材料から、核酸をきれいに取りたい、できれば簡単にとりたい、

さらにできれば安くとりたい・
・・。

研究者のこんな願いを解決してきた「すいすい」シリーズ




その中でも、「抽出不可能」とまで言われた材料からの抽出を可能にしたライ

ンナップが、「RNAすいすい-P」です。




その材料とは、光合成研究でよく使われるカヤツリグサ科の水草である「エリ

オカリス」


その植物体からのRNA抽出は、これまでに成功例がなかったといいます。




あるお客様より、RNAの確保に苦労していたが、RNAすいすい-Pをベースにした

独自の方法できれいなRNAの抽出に成功し、懸案だったマイクロアレイによる

遺伝子発現解析に進むことができた
、という、うれしいお知らせをいただき、

ブログにもご紹介しました。

http://rizo-inc.cocolog-nifty.com/blog/2010/09/rna-8e3f.html




カヤツリグサ科は核酸抽出が難しいものが多く、雑草「ヒメクグ」からの

RNA抽出でお困りのお客様にも使っていただきました。

雑草といえば他にも、田んぼの雑草である「タイヌビエ」「イヌホタルイ」

「種子」(見るからに手ごわそうな材料でした)からのRNA抽出にも、RNAすい

すい-Pがお役に立ちました。

http://rizo-inc.cocolog-nifty.com/blog/2010/10/post-5984.html




植物以外の材料にも実績があります。

あるお客様は、「ポリフェノール存在下で培養した微生物」からのRNA抽出でお

困りだったそうですが、やはりRNAすいすい-Pで解決されました。

http://rizo-inc.cocolog-nifty.com/blog/2010/09/rna-f9fc.html




RNAすいすい-Pは、カラム抽出にも対応していますので、通常のプロトコルでは

取り除けない着色物質や多糖類がある場合には、カラムを併用することできれ

いなRNAを確保できます。


使い方は簡単。




酸性フェノール処理後の上清をカラムに通して吸着、

70%エタノールで洗浄、

DEPC処理水で溶出。

「イソプロ沈の代わりにカラムを使う」というイメージです。

(注:酸性フェノール処理を省略することはできません)


吸着後、洗浄の前に、DNAse溶液をしみこませて5分おくことにより、


「オンカラムでのDNase処理」も簡単にできます

詳細なプロトコルもお出しできますので、ご希望の場合はお知らせください。




カラムは、他社製品ですが、単品売りのRNA精製用カラムをお使いください。

(弊社では、FAVORGENのカラムを抽出法検討に利用しています。

詳細はチヨダサイエンス様のHPをご覧ください

http://www.chiyoda-s.jp/extraction-column.html




現在も、難しい材料からのRNA抽出を解決し続けているRNAすいすい-P。

弊社で抽出法検討のご相談を受けた場合、手ごわそうなものはとりあえずこれで

試します。そのまま、あるいはプロトコルの改変で解決することが多く、なかな

か頼れるバッファーとなっています。




RNAすいすい-Pのご案内はこちらです。

http://rizo.co.jp/RNA-P.html




<<その他の「RNAすいすい」シリーズのご案内>>


澱粉の多い植物組織向け

RNAすいすい-S

http://rizo.co.jp/RNA-S.html


粘性物質の多いバラ科植物向け

RNAすいすい-R

http://rizo.co.jp/RNA-R.html


魚類体表粘膜・組織向け

RNAすいすい-F

http://rizo.co.jp/RNA-F.html




(DNA抽出バッファー「DNAすいすい」シリーズ
もございます。)


 


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