イリヤスフィール・フォン・アインツベルンは私立穂群原学園に通うごく普通の小学校５年生で兄の衛宮士郎と家に帰り届いたアニメのDVDを姉のリーゼリットと観て家政婦のセラが呆れます
一方遠坂凛は協力して行う任務の為にルヴィアゼリッタ・エーデルフェルトと日本に着きます
だが凛とルヴィアはお互いに歪み合って大人気ない戦いをしてしまいカレイドステッキのマジカルルビーとマジカルサファイアは愛想を尽かしてしまい２人は強制的に転生を解かれてしまいます
同じ頃イリアはアニメのDVDを見終わった後に湯船に浸かりながら魔法に対する願いをしていた時にイリアの前にマジカルルビーが現れて
マジカルルビーはイリヤにいきなり
｢魔法少女をやらないか？｣
と言ってイリアは胡散臭く感じます
だがイリアは勢いでマジカルルビーを握ってしまいそのままマスター契約をしてしまい
イリヤは魔法少女プリズムイリヤに変身してしまいます
そこに凛が現れてイリヤからマジカルルビーを引き取ろうと戦闘になりますが
凛はマスターを自分に戻すのを諦めてイリヤに
｢これからあなたは魔法少女になってクラスカードを集めるのよ｣
と命じるのだった
という展開です