サーバーなどに使われる、CPUやチップなどの電子回路を、読み取り用、書き込み用、描画用、ネット用など、それぞれの目的の電子回路に分け、必要に応じて接続して使い分ける形にすると、ハッキングを受けにくい形になると思います。
各電子回路も、カートリッジなどに詰め込んで、マザーボードに抜き差しして使う形にするのもいいと思います。
少なくとも、書き込みに対応した電子回路がないと、ネットを通した書き換えはできなくなると思うので、セキュリティを上げる意味でも、CPUやチップの分割は、必要だと思います。
（サーバー稼働中は、読み込み用回路だけを繋ぐのもいいかもしれません）