thrown in at the deep end=深い終わり(底)に投げ捨てられる。

つまり、いきなり(準備もなく)新しい世界へ放り込まれる、慣れない仕事などを急にやらされる。

 

I was thrown in at the deep end when my manager gave me a new project. I was only given few days' notice to get everything ready.