【東海道線】
（東日本）
南武線／南武支線
鶴見線／海芝浦支線／大川支線
武蔵野線
横須賀線
相模線
伊東線
（東海）
東海道本線（熱海～米原間）／美濃赤坂線
御殿場線
身延線
飯田線
武豊線
（西日本）
東海道本線（米原～京都間）〈琵琶湖線〉
東海道本線（京都～大阪間）〈京都線〉
東海道本線（大阪～神戸間）〈神戸線〉
湖西線
大阪環状線
桜島線〈ゆめ咲線〉
ＪＲ東西線
福知山線〈宝塚線〉
【北陸線】
北陸本線
小浜線
越美北線〈九頭竜線〉
七尾線
城端線
氷見線
【高山線】
高山本線
【中央線】
（東日本）（西日本）
中央本線（東京～塩尻間）／辰野支線
青梅線〈東京アドベンチャーライン〉
五日市線
八高線
篠ノ井線
大糸線〈北アルプス線〉
（東海）
中央本線（塩尻～名古屋間）
太多線
【山陽線】
山陽本線／和田岬線
播但線
姫新線
赤穂線
津山線
吉備線〈桃太郎線〉
宇野線〈宇野みなと線〉
本四備讃線〈瀬戸大橋線〉
伯備線
芸備線
福塩線
呉線
可部線
岩徳線
山口線
宇部線
小野田線／本山線
美祢線
【山陰線】
山陰本線（京都～園部間）〈嵯峨野線〉
山陰本線（園部～幡生間）／仙崎線
舞鶴線
因美線
境線
木次線
【関西線】
（東海）
関西本線（名古屋～亀山間）
（西日本）
関西本線（亀山～加茂間）
関西本線（加茂～ＪＲ難波間）〈大和路線〉
草津線
奈良線
桜井線〈万葉まほろば線〉
片町線〈学研都市線〉
おおさか東線
和歌山線
阪和線／羽衣線
関西空港線
【紀勢線】
（東海）
紀勢本線（亀山～新宮間）
名松線
参宮線
（西日本）
紀勢本線（新宮～和歌山市間）〈きのくに線〉
【東北線】
東北本線（黒磯～盛岡間）／利府線
埼京線／川越線
常磐線
水郡線／常陸太田線
高崎線
上越線
吾妻線
両毛線
水戸線
日光線
烏山線
仙山線
仙石線
石巻線
気仙沼線
大船渡線〈ドラゴンレール大船渡線〉
北上線
釜石線〈銀河ドリームライン釜石線〉
田沢湖線
山田線
花輪線〈十和田八幡平四季彩ライン〉
八戸線〈うみねこレール八戸市内線〉
大湊線〈はまなすベイライン大湊線〉
【磐越線】
磐越東線〈ゆうゆうあぶくまライン〉
磐越西線〈森と水とロマンの鉄道〉
只見線
【奥羽線】
奥羽本線（福島～新庄間）〈山形線〉
奥羽本線（新庄～青森間）
米坂線
左沢線〈フルーツライン左沢線〉
男鹿線〈男鹿なまはげライン〉
五能線
津軽線
【羽越線】
羽越本線
白新線
【陸羽線】
陸羽東線〈奥の細道湯けむりライン〉
陸羽西線〈奥の細道最上川ライン〉
【信越線】
信越本線（高崎～横川間）
信越本線（篠ノ井～長野間）
信越本線（直江津～新潟間）
飯山線
越後線
弥彦線
【総武線】
総武本線／支線
京葉線
外房線
内房線
成田線／空港支線／我孫子支線
鹿島線
久留里線
東金線
【予讃線】
予讃線〈愛ある伊予灘線〉
内子線
予土線〈しまんとグリーンライン〉
【高徳線】
高徳線
鳴門線
【徳島線】
徳島線〈よしの川ブルーライン〉
牟岐線〈阿波室戸シーサイドライン〉
【土讃線】
土讃線
【鹿児島線】
鹿児島本線（門司港～八代間）
鹿児島本線（川内～鹿児島間）
香椎線〈海の中道線〉
篠栗線〈福北ゆたか線〉
博多南線
三角線〈あまくさみすみ線〉
肥薩線〈えびの高原線〉
指宿枕崎線
【長崎線】
長崎本線／旧線
唐津線
筑肥線
佐世保線
大村線
【久大線】
久大本線〈ゆふ高原線〉
【豊肥線】
豊肥本線〈阿蘇高原線〉
【日豊線】
日豊本線
日田彦山線
日南線
宮崎空港線
吉都線〈えびの高原線〉
【筑豊線】
筑豊本線（若松～折尾間）〈若松線〉
筑豊本線（折尾～桂川間）〈福北ゆたか線〉
筑豊本線（桂川～原田間）〈原田線〉
後藤寺線
【函館線】
札沼線〈学園都市線〉
【室蘭線】
【日高線】
日高本線
【留萌線】
留萌本線
【根室線】
富良野線
【宗谷線】
宗谷本線
【石北線】
石北本線
【釧網線】
釧網本線