ちょっと考えにくいバグなのだけど、どうしてこうなるの？

気になるのが、河野大臣のこの発言。

河野氏は同トラブルについて、「マイナンバーカードあるいはマイナンバーカードを使った情報連携の仕組みに問題があるのではないかと受け取る人が大勢いると思うが、この問題は横浜市の証明書発行サービス（Fujitsu MICJET コンビニ交付）のアプリケーションの問題であり、マイナンバーカードの信頼性に影響するものではない」と補足した。

おそらく、大元の住基ネットとマイナンバーカードは大丈夫ですよとおっしゃりたいのだと推察しますが、そこが大丈夫であっても連携していてる部分でこのようなバグが発生してしまうと、全体としての信頼性に関わってくる話になると思います。