おつりは出ません。ATMへ投下された金額がすべてチャージされます。
例:3,000円チャージ(入金)したい場合、3,000円を投入ください。10,000円札をATMに投入し、おつり7,000円のお取引はできず、10,000円チャージ(入金)となります。
(ローソン銀行から抜粋)

何故!非常に不便!!
多少なり現金を手元に残しておきたいときに、全額入金になるのは厳しい。
すべての店が電子マネー対応ではないのだから、細かいお金が必要な時は他銀に行かなくてはならない。
技術的に出来ないとは思えない(他銀とのからみ?)ので、これは是非解決してほしい。