ibus.elとmozc.elの違いよく、わかっていません。mozc.elを使う場合、ibus.elは必要ないのかもしれないです。
ibus.elだけインストールした場合、Cannaが変換エンジンになっているのか日本語も日本語として変換できない状態でした。二本語とかになっていました。
emacs-mozcはコンパイル済みのelcがインストールされるみたいです。
ATOK X3 for Linuxだといろいろ問題の起こったFedora13ですが、とても快適になりました。mozcの辞書もATOK X3 for Linuxの登録辞書をインポートしました。ATOKの他にもフォーマット指定できるみたいです。
（インストール）
sudo yum -y install ibus-mozc emacs-ibus-el
sudo yum -y install emacs-mozc
（.emacsの設定）
(set-language-environment "japanese")
(require 'mozc)
(setq default-input-method "japanese-mozc")
;; ibus-mode
(require 'ibus)
;; Turn on ibus-mode automatically after loading .emacs
(add-hook 'after-init-hook 'ibus-mode-on)
;; Use C-SPC for Set Mark command
(ibus-define-common-key ?\C-\s nil)
;; Use C-/ for Undo command
(ibus-define-common-key ?\C-/ nil)
;; Change cursor color depending on IBus status
(setq ibus-cursor-color '("limegreen" "white" "blue"))
(setq ibus-prediction-window-position t)
(global-set-key [(hiragana-katakana)] 'ibus-toggle)
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