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①
「腸内細菌叢は急性COVID-19後症候群の表現型発現と関連性している」
元論文の機械翻訳(抜粋)
腸内細菌叢と急性COVID-19症候群の表現型との関連性
ハイライト
・急性COVID-19症候群(PACS)患者の腸内細菌叢を解析した。
・腸内細菌叢の組成はPACSの不均一性と関連する
・腸内細菌型はPACSの異なる表現型と関連する
・マイクロバイオームベースのマルチラベル機械学習モデルはPACSの症状を正確に予測する。
要約 急性COVID-19後症候群(PACS)の多くの表現型症状の根底にあるメカニズムは十分に理解されていない。ここで我々は、PACS患者の異種コホートにおける腸内細菌叢を特徴付け、微生物叢を用いて特定の症状を予測するためのマルチラベル機械学習モデルを開発した。我々の処理したデータは、585の細菌種と500の微生物経路をカバーし、PACSの個人間変動の12.7%を説明した。PACS患者において、3つの腸内細菌型が同定され、異なる表現型と関連した。訓練されたモデルは、テストセットにおけるPACSの個々の症状の予測において0.89の精度を示し、PACSを発症する前の独立した縦断的コホートにおける今後の症状の予測において86%の感度と82%の特異度を維持した。本研究は、腸内細菌叢がPACSの表現型症状と関連していることを示しており、PACSの予測および診断に臨床的有用性が期待される。
②
「肺胞マクロファージの腸内細菌叢プログラミングは呼吸器ウイルス感染の重症度に影響する」
元論文の機械翻訳(抜粋)
肺胞マクロファージの腸内細菌叢プログラミングは呼吸器ウイルス感染の重症度に影響する
ハイライト
・腸内細菌叢の構成が呼吸器ウイルス感染症の重症度に影響する
・腸内細菌叢が肺マクロファージを再プログラムする
・補体およびNotch4の発現レベルがウイルス感染の重症度に影響する
・肺マクロファージの移植により呼吸器ウイルス感染症への罹患率が変化する
要約 呼吸器ウイルス感染症(RVI)に対する感受性は個人差が大きい。腸内細菌叢が免疫機能に影響を及ぼすことから、我々は腸内細菌叢の構成がRVIに及ぼす影響を検討し、自然獲得または外因的に投与された分割型糸状菌(SFB)がインフルエンザウイルス(IAV)感染からマウスを保護することを明らかにした。このような防御は、呼吸器合胞体ウイルス(RSウイルス)や重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)にも適用され、インターフェロンや適応免疫とは無関係であったが、肺胞マクロファージ(AMs)が必要であった。SFB陰性マウスでは、RVIの進行とともにAMsは急速に枯渇した。対照的に、SFBを獲得したマウスのAMは、IAVによる枯渇と炎症シグナルに抵抗するように本質的に変化していた。しかし、SFBコロニー化マウスのAMは静止状態ではなかった。むしろ、補体産生と貪食作用の亢進を介して、IAVを直接無効化した。したがって、SFBを形質転換したAMをSFBを持たない宿主に移植すると、SFBを介したIAVに対する防御が再現された。これらの知見から、腸内細菌叢とAMの機能性およびRVIの重症度をメカニズム的に結びつける複雑な相互作用が明らかになった。
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関連記事より抜粋
細菌は菌糸の「高速道路」を移動し「通行料」を払う~細菌と糸状菌の知られざる共生関係を発見~
細菌と糸状菌はいずれも、自然界に広く存在する主要な微生物で、互いに作用して、それぞれの特徴的な機能を発揮していることが明らかとなってきています。また、菌糸ネットワークが、細菌の増殖と移動に重要であることも分かってきました。そこで本研究では、細菌と糸状菌のモデル生物であるBacillus subtilis(枯草菌)とAspergillus nidulansを共培養し、これらの相互作用を解析しました。
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