5年前の雨の日、野原ひろしとみさえの間に
赤ちゃんが生まれた。
ひろしが考えた名前のメモは濡れてほとんど読めなく
なっていたが、かろうじて読めた文字から「しんの
すけ」になった。
それから5年の歳月が流れたある日、野原家にちよめと
名乗る女性が訪れ、自分がしんのすけの本当の親だと
主張する。
突然のことにひろしとみさえは戸惑うが、身ひとつでやってきた
ちよめを追い返すわけにもいかず、ひとまず彼女を家に泊めることに。
するとその夜、謎の忍者軍団が野原家を襲い、ちよめとしんのすけが
連れ去られてしまう。