1999年、スヴェン-ゴラン-エリクソン監督が率いるSSラツィオに移籍し、ベテランのネストル-センシーニ、マティアス-アルメイダ、エルナン-クレスポ、優れたパス技術を持つフアン-セバスティアン-ベロンなど多くのアルゼンチン人選手たちとともにプレーした。彼らのチームはシメオネの加入とともにスクデット争いに加わり、シメオネはユヴェントスFCとの白熱した首位争い参加に貢献した。最終節を前にして勝ち点2差を付けられていたが、ユヴェントスFCは雨中のペルージャ-カルチョ戦に敗れ、SSラツィオはホームのスタディオ-オリンピコでレッジーナ-カルチョ相手に会心の勝利を挙げたため、自身初となるセリエAのタイトルを手に入れた。1999-2000シーズンはコッパ-イタリアでも決勝でインテルを破って優勝し、スペイン時代に続く2冠を達成した。その後、2002-03シーズンまでSSラツィオでプレーした。2001-02シーズン最終節のインテル戦では古巣相手にゴールを決め、インテルのリーグ制覇の夢を打ち砕いた。
2003年にアトレティコ-マドリードに復帰し、2シーズンプレーした後に母国のラシン-クラブに移籍した。ファンであるラシン-クラブで引退するという願いが叶い、長い選手生活を終え、2006年に引退した。