佐渡観光そのものの衰退もあることは事実で、その対策として、昨年秋、そして今年春に、新潟県や佐渡市など共同で「佐渡航路運賃割引社会実験」と称して、運賃の割引を期間限定で実施しています。
http://www.pref.niigata.jp/kowankuko/koutsuseisaku/sado/sadojikken.html
確かに効果はあるようですが、その効果は(割引期間だけの)限定的なものになっているように見えます。
長期的に実施し、実際に佐渡を訪れることで、佐渡の良さを多くに人に知ってもらい、割引なしでも行くような状況にすることが必要な気がします。