イラストレーターから「レイヤーを保持」しながら、Photoshopに書き出す場合、「AIドキュメント内の一部のコンテナが分割・統合されました」というエラーが出て、レイヤーが合体されて書き出されてしまう場合がある。
これはイラストレーターでレイヤー分けをした場合、レイヤーを超えて「透明効果・乗算」した場合に起こる。
つまり（画像参照）
イラストレーターで「レイヤー１マゼンタ」「レイヤー２シアン」というふうに２つのレイヤーを作ったとする。
「レイヤー２シアン」に「透明効果の乗算」をかけた場合、違うレイヤーのオブジェクトに対して「透明効果の乗算」がかかるため、Photoshopに書き出す場合、うまくレイヤーが分割できず、統合されて書き出されてしまう。
どうしてもレイヤーを保持したままphotoshopに書き出したい場合は「透明効果」は「通常」にして、書き出した後、photoshopの機能で「乗算」等の効果をかけることをお勧めする。