maqのdemoをやってみる
サーバにアクセスしてやってみよう。
minako@hoge:~/maq
> maq.pl demo fm200053.fasta calib-36.dat
-- CMD: mkdir -p maqdemo
。。。。。。。いろいろ。。。
。。。。。
うまくいってそう。。。
minako@hoge:~/maq/maqdemo/easyrun
> ls
all.map cns.filter.snp cns.indelpe cns.win read1@1.bfq
aln@1.map.log
cns.final.snp cns.indelse consensus.cns read2@1.bfq
assemble.log cns.fq cns.snp mapcheck.txt ref.bfa
うまくいってそうだ。。。
出来てはいるのにmaqviewとかmaqindexができない。
maqview内のREADMEを読んでみて追加。
minako@hoge:~/maq/maqview
> ./autogen.sh
minako@hoge:~/maq/maqview
> ./configure
minako@hoge:~/maq/maqview
> make
なんかmakeはエラーしてそうだ。。。
これもmake installするのだろう???か??
root権限ないし。。。
出来てはいるのにmaqviewとかmaqindexができない。。