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漫画ときどき研究者

読んだ漫画と論文の感想を書いていくブログです。
ジャンプを読むように論文を読めるようになることが目標です。

L1 retrotransposition in neurons is modulated by MeCP2.

Muotri AR, Marchetto MC, Coufal NG, Oefner R, Yeo G, Nakashima K, Gage FH.

Nature. 2010 Nov 18;468(7322):443-446.

レット症候群 という病気をご存知でしょうか。
この病気では、生後に発症する進行性の神経疾患で、未だに有効な治療法がない病気です。
現在までに、MeCP2という原因遺伝子が同定されており、世界的に精力的に研究がおこなわれています。
MeCP2はDNAのメチル化酵素で、一般的にはメチル化した付近にある遺伝子の発現を抑える効果があると言われています。
従って、MeCP2がなくなると、色々な遺伝子の抑制がはずれてしまうので、確かに色々と良くないことが起こりそうに思えるのですが、具体的に何の抑制が外れてしまうのかはあまり分かっていなかったようです。

筆者らは、その候補の一つであるLINE-1というトランスポゾン に注目しました。
neural stem cellでのLuciferaseレポーター実験とマウス個体を用いたEGFPレポーター実験から、確かにMeCP2がなくなるとL1トランスポゾンが移動しやすくなる(i.e. 抑制が弱くなる)ことを確認しました。
また、L1トランスポゾンがゲノムにどれくらいの数(コピー数)入っているかをqPCRで調たところ、これも確かに増えていました。
さらには、ヒトのレット症候群の患者さんの細胞から作ったiPS細胞を用いて、実際にヒトの患者さんでもL1トランスポゾンの移動が増していることが示されました。

ただし、これがレット症候群の原因なのか、それとも単なる病気の二次的な効果なのかは分からないと議論しています。
まあそれが示せていないからarticleではなくletterなんでしょうが。

こういう研究が出てくると、iPS細胞の意義を改めて認識することができますね。
これからは、こういう病気のモデル動物の研究では、当たり前にヒトのiPS細胞を使った実験も求められるようになってくるんだと思います。
評価:★★★★★★★★☆☆
帯をギュッとね!―New wave judo comic (24) (少年サンデーコミックス)/河合 克敏
¥398
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えーと、まずは不適切な画像をお見せしたことをお詫び申しあげます。(藤田君ご愁傷様です。)
決してそっち系のマンガではありませんので。
いや、この巻以外の表紙はまともなんですよ。ほんとに。

さて、先日とめはねっ! を読んでいた際、やけにうまく描かれた柔道シーンを見て、この”帯をギュッとね!”を読みたくなり、一気に全巻読みました。
私の中では柔道マンガといえば、YAWARAよりも帯ギュだと思っているくらい好きなスポーツマンガです。

あらすじは、柔道部のない高校に入学してしまった5人が、柔道部を創設し、ライバルたちと切磋琢磨しながら成長していく、青春スポーツものです。
個人的には実にサンデーらしいマンガだと思っていて、尻上がりに面白くなっていき、最終巻で興奮が最高潮に達する構成になっています。
主人公たち、ライバルたち、女性陣、ほぼすべてのキャラが”異様に”魅力的で、とてものめりこみやすいので、スポーツもの、もしくは青春ものが好きな方は是非ご一読を。

さて、このマンガには、もうひとつ魅力があります。
それは、巻末の読者投稿コーナーです。
残念ながら私が今持っている文庫版にはついていないのですが、昔に友人に借りて読んだ時の記憶では、かなりおもしろかった思い出があります。
確か送られてきたイラストから大賞を決めたりしていたはずなんですが、最初の大賞はなんと、烈火の炎の作者の安西先生なんです。
デビュー前の安西先生が描いた桜子のイラストも見られる帯をギュッとね、是非オリジナルの単行本でお楽しみください。

色々忙しくて更新が滞っております。
ただ働きをやらされてTAをやっていて自分の時間がとれず。。。。。。
そういうわけで、今日も漫画れびゅーではないです。すみません。

今日は、先日upした 顕微鏡のデータ整理プログラムなのですが、イマイチうまくパノラマ写真にできなかったので一部修正しました。
ここ2週間ほど使っていてうまくいっているので、大きな問題はないと思います。
相変わらず需要はないと思いますが、一応下にコードを載せておきます。

dir = getDirectory("Choose a Directory"); //作業フォルダを選択
folderlist = getFileList(dir); //フォルダ情報をすべて取得
for(i=0; i<folderlist.length; i++){
//print(folderlist[i]);
FolderName = folderlist[i];
Name = File.getName(dir + FolderName);
list = getFileList(dir + FolderName); //作業フォルダ内のファイル情報をすべて取得
File.makeDirectory(dir + FolderName + "tif"); //作業フォルダ内にtifファイルを保存するフォルダを作製
for(j=0; j<list.length; j++){
if(endsWith(list[j], "ics")){ //icsファイルの時のみ以下の操作を行う
run("Open...", "path=" + dir + FolderName + list[j]);
name = my_nameWithoutExtension(list[j]); //拡張子を取り除く
selectWindow(name + " ch: 2"); //488のチャネルの画像を選択
run("Z Project...", "start=1 stop="+nSlices+" projection=[Max Intensity]");
run("8-bit");
saveAs("Tiff", dir + FolderName + "tif/" + name);
run("Close");
for(k=1; k<5; k++){ //stack前の画像を閉じる
selectWindow(name + " ch: "+k);
run("Close");
}
}
}
run("Stitch Directory with Images (unknown configuration)", "image_directory="+dir+""+FolderName+"tif output_file_name=TileConfiguration.txt rgb_order=rgb channels_for_registration=[Red, Green and Blue] fusion_method=[Max. Intensity] fusion_alpha=1.50 regression_threshold=0.30 max/avg_displacement_threshold=2.50 absolute_displacement_threshold=3.50");
//selectWindow("Merge-"+count-1+".tif");
saveAs("Tiff", dir + Name);
//print("ok");
run("Close");
}

//拡張子を取り除く
function my_nameWithoutExtension(str){
n = lastIndexOf(str, ".");

if(n>=0) rstr = substring(str, 0, n);//拡張子が存在する場合
else rstr = str;//"."拡張子が存在しない場合

return rstr;
}