２次リーグ（上位リーグ）が以下組み合わせで開始した。
＜グループ２Ａ＞
東京ヴェルディ
ＦＣ東京深川
横河武蔵野ＦＣ
ＦＣ町田ゼルビア
田口ＦＡ
ＧＩＵＳＴＩ世田谷
＜グループ２Ｂ＞
ＦＣ東京むさし
三菱養和ＳＣ調布
ヴェルディＡＪＵＮＴ
インテリオールＦＣ
Ｓ.Ｔ.Ｆ.Ｃ.
ＦＣ杉野
＜グループ２Ｃ＞
三菱養和ＳＣ巣鴨
ＦＣトリプレッタ
ジェファＦＣ
ＳＫオンゼ
三鷹ＦＡ
＜グループ２Ｄ＞
Ｆｏｒｚａ`０２
ＦＣ多摩
ＡＺ'86東京青梅
府ロク
東京ベイＦＣ
※各グループ１・２位は決勝トーナメントへ、３～６位は３次リーグへ。