Q-A: He may have missed the train, in which case we must wait for another hour.
関係詞(関係形容詞)の問題です。
関係詞のwhichには、「物(前の名詞)」や「亊(前文の内容)」を先行詞として受ける「関係形容詞」としての用法があります(この用法は「非制限用法」でのみ使われます)。意味は、通例、「そしてその～」(and the ~)「しかしその～」(= but the ~)と訳される場合が多いです。
よって、問題文(彼はその電車に乗り遅れたのかもしれない。その場合、私たちはもう１時間待たなければならない。)は、正しい。