411話「神社鳥居ビックリ暗号(前編)」
48巻file1「夏休みの暗号」
file2「寝転んで顔を洗え！」
file3「パーフェクト解読‼︎」
セリフ：星ってなんだか魅力的。犯人だったり俳優だったり。今日の舞台は村の鎮守。見慣れた文字の裏側に意外な秘密が隠れてる！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
冒頭に探偵団が歌うシーンが追加
園子の「あんたの亭主」が「あんたの旦那」になっている
道具 ネクタイ2
死者 現1 撲殺
ヒント 表と裏
コント 歩美「逆さま同じ言葉！」光彦「たけやぶやけた」歩美「すごーい！」元太「みーみ」コナン「えっ…」
412話「神社鳥居ビックリ暗号(後編)」
48巻file1「夏休みの暗号」
file2「寝転んで顔を洗え！」
file3「パーフェクト解読‼︎」
セリフ：星ってなんだか魅力的。犯人だったり俳優だったり。博士の出した変な暗号。思わぬ苦戦の探偵団。最初に解くのは一体誰？たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
元太の「あれれ〜」が聞ける
道具 ネクタイ2
死者 なし
ヒント 二つのカップ
コント 光彦「次回のタイトルって…」元太「完全の半分だから、うな重でいうとー…」光彦「えっ？」
413話「完全半分犯罪の謎」
アニメオリジナル
セリフ：星ってなんだか魅力的。犯人だったり俳優だったり。今日の舞台はテレビ局。番組作りの情熱がどこかで曲がって事件に発展！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
広田刑事が千葉一伸
道具 麻酔、ネクタイ
死者 現1 毒殺(青酸系)
ヒント 醤油
コント コナン「来週は青い鳥」目暮「何、阿波踊り？」コナン「違うよ、モグレ警部」目暮「ワシは目暮！」
414話「青い鳥を追う探偵団」
アニメオリジナル
セリフ：星ってなんだか魅力的。犯人だったり俳優だったり。由香ちゃんが飼ってる青い鳥。幸せのはずが事件を呼んじゃう。急いで守れ探偵団！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
帝丹小1年C組の紺野由香登場
灰原登場
道具 なし
死者 過1 病死(事件性なし) 現インコ
ヒント 癖
コント 元太「秋の七癖言ってみよう！」光彦「爪を噛むでしょ…、鼻をほじる…っておーい！」
415話「仏滅に出る悪霊(事件編)」
48巻file4「悪霊の棲む屋敷」
file5「13年前の悪夢」
file6「蘇る悪霊」
file7「見過ごしていたもの」
file8「13年目の衝撃」
セリフ：コナンはまもなく10周年！一つ越えたらすぐ次目指せ！やっぱり気になる仏滅の暦。悪夢が引き出す心霊現象。セキュリティー超え事件発生！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
OPが「Growing of my heart」に
綿引にボールペンを渡すのが蘭ではなくコナンになっている
赤塚賢造が冨田耕生(2代目鈴木次郎吉)
綿引勝史が石田彰(初代白馬探)
道具 なし
死者 現1 絞殺
ヒント 指紋
コント 蘭「コナン君、指紋見せて」コナン「うん」蘭「はっ、この指紋は新一！」コナン「えっ…」蘭「驚いた？」コナン「へっ？」
416話「仏滅に出る悪霊(疑惑編)」
48巻file4「悪霊の棲む屋敷」
file5「13年前の悪夢」
file6「蘇る悪霊」
file7「見過ごしていたもの」
file8「13年目の衝撃」
セリフ：コナンはまもなく10周年！一つ越えたらすぐ次目指せ！第二の事件に深まる疑惑。あるはずないものの存在が悪霊騒ぎに拍車をかける！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
赤塚賢造が冨田耕生(2代目鈴木次郎吉)
綿引勝史が石田彰(初代白馬探)
道具 なし
死者 現1 心臓発作 過3 溺死(水難事故)
ヒント 兄弟
コント コナン「次回は解決！でも本当に幽霊の仕業だったりして…」蘭「コラァー」コナン「あ、いて、ごめんなさ…」
417話「仏滅に出る悪霊(解決編)」
48巻file4「悪霊の棲む屋敷」
file5「13年前の悪夢」
file6「蘇る悪霊」
file7「見過ごしていたもの」
file8「13年目の衝撃」
セリフ：コナンはまもなく10周年！一つ越えたらすぐ次目指せ！クライマックス仏滅事件。ふとした蘭の一言が見落としかけてた推理に響く！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
序盤の横溝警部による事件の振り返りがカット
コナンが小五郎に麻酔針を打ち込むシーンがカット
EDが「Thank You For Everything」に
赤塚賢造が冨田耕生(2代目鈴木次郎吉)
綿引勝史が石田彰(初代白馬探)
綿引勝史の弟が石田彰(初代白馬探)
刑事が千葉一伸
道具 麻酔、ネクタイ
死者 過1 病死(事件性なし)
ヒント 表札
コント コナン「次回は久しぶりにあの二人が…！」蘭「あの二人って？」コナン「それは来週のお楽しみー」
418話「米花町グルニエの家」
アニメオリジナル
セリフ：コナンはまもなく10周年！一つ越えたらすぐ次目指せ！新築の家に謎の老夫婦。なぜか気になる視線と気配。狙いはオレか灰原か⁉︎たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
工藤有希子、工藤優作アニメオリジナル初登場
灰原哀登場
博士が元太を呼び捨てにする珍しいシーンがある
道具 なし
死者 なし
ヒント 観光地
コント 阿笠「観光地といえば…？」歩美「乾電池！」光彦「缶コーヒー！」阿笠「京都」歩美「げ、ノリわるー…」
419話「八岐大蛇の剣(前編)」
アニメオリジナル
セリフ：コナンはまもなく10周年！一つ越えたらすぐ次目指せ！出会いの神のイタズラか、八岐大蛇になぞらえた事件の謎にコナンが挑む！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
ミステリーツアー第6弾
島根県警の山根刑事と小村刑事
道具 なし
死者 現1 刺殺
ヒント 嘘の証言
コント コナン「縁結び新一兄ちゃんと？」蘭「違うよ♪」コナン「え…じゃ誰？」蘭「フフン♪」コナン「ねっ、だ、誰？」
420話「八岐大蛇の剣(後編)」
アニメオリジナル
セリフ：コナンはまもなく10周年！一つ越えたらすぐ次目指せ！相手を想う優しさと、誤解を生んだ事件の先に、神話の里の真犯人！たった一つの真実見抜く見た目は子供頭脳は大人、その名は名探偵コナン！
備考
ミステリーツアー第6弾
島根県警の山根刑事と小村刑事
成瀬市は杯戸市に合併されてなくなっている
道具 ネクタイ、麻酔
死者 なし
ヒント 10年ごとの約束
コント コナン「次回はあの人の恋の話」蘭「新一とはそんなんじゃないし…」コナン「蘭姉ちゃんじゃないし…」蘭「え…」