犬の染色体は78本、39対からなる。
38対は常染色体、1対は性染色体で性別を決定する。
常染色体（毛色の遺伝）
・A：As（ｾﾙﾌ）濃い色素が全体に均一に行きわたる遺伝情報
ay（ﾚｯﾄﾞ､ﾀﾝ）、as（ｾｰﾌﾞﾙ、ﾜｲﾙﾄﾞﾎﾞｱ）、at（ﾀﾝﾎﾟｲﾝﾄ）は部分的に色が混入するのかが決まる遺伝情報
・B：B（ﾌﾞﾗｯｸ）濃いメラニンを含む分子が黒として発色
b（ﾁｮｺﾚｰﾄ）
bbはブラウンとして発色する
・C：C（完全な色素形成、沈着）
cch（色素減少、ﾁﾝﾁﾗ褐色）
色素の形成や減少などのメラニンの統合に関する遺伝シリーズ
・D：D（濃い色の色素形成、沈着）
d（ﾌﾞﾙｰ褐色）
色素形成やﾌﾞﾙｰ褐色を遺伝するシリーズ
はっきりとした発色をするDと青みがかった灰色（ブルー）を発色するddとなる
ddは皮膚、目、鼻などが薄くなるのが特徴で、くすんだ感じの色合いになる。カフェオレはddが作用したものと考えられる
・E：edr（ﾌﾞﾘﾝﾄﾞﾙ）
E（ｿﾘｯﾄﾞｺｰﾄｶﾗｰ）
e（制限遺伝子または劣性のﾚｯﾄﾞ､ｲｴﾛｰ）
プードルではEは黒として発色させ、eeの場合はレッド系が現れる
・G：g（生涯ｸﾞﾚｰに変化していかない遺伝子）
Gは加齢に伴う白髪化に影響する遺伝子とされ、ggの場合は加齢によっても毛色が変化しないとされる
・M：M（ﾀﾞｯﾌﾟﾙ）
ｍ（ｿﾘｯﾄﾞｶﾗｰ）
ダックス、コリー、グレートデンの毛色を遺伝するシリーズ
・S：S（ｾﾙﾌ、全身に色素がみられる）
Sp（ﾊﾟｲﾎﾟｰﾙﾄﾞ､ﾎﾜｲﾄ･ｽﾎﾟｯﾄ）
全身の色素やパイポールドを遺伝するシリーズ
斑点の形成に関わる遺伝子
・T：T（ﾃｨｯｷﾝｸﾞ）、t（ﾃｨｯｷﾝｸﾞなし）
ティッキングとは白地に黒など濃い毛色が集まり、小さく孤立した部分を形造る