外部参照しているオブジェクトを編集する時に、それ以外のオブジェクトも一緒に選択されてしまう。

外部参照を編集ダイアログボックス

（外部参照しているオブジェクトをダブルクリックすると表示）

の設定タブで、

「作業セットにないオブジェクトをロック」のチェックを入れます。