2007年3月現在のマザーズ指数は約1000であり、2003年9月の導入当時と同じ水準にまで下落しており、マザーズ指数のチャートも2004年7月と2006年1月にダブル天井をつけています。日経平均株価や東証株価指数（TOPIX）が2003年以降上昇トレンドを描いているのとは対照的です。
マザーズ指数のチャートは2004年7月とライブドア事件の起こった2006年1月にいずれも約2800でダブル天井をつけて、それ以降現在まで下落トレンドが続いています。2007年3月20日時点のマザーズ指数は1031であり2003年の指数導入時と同水準となっています。