特定口座とは？
株の売買で利益が出たら、原則として確定申告で税金を納める必要があります。その際には、一年間の売買履歴（年間取引報告書）なども提出する必要があります。特定口座とはそうした作業を証券会社が無料で行ってくれるサービスです。
口座開設の際には
・「特定口座(源泉徴収アリ）」
・「特定口座(源泉徴収ナシ)」
・「一般口座」
の３つ中から自由に選択することが出来ます。
・特定口座(源泉徴収アリ）を選ぶと証券会社が利益が発生するたびに納税してくれます。そのため確定申告は不要になります。
・特定口座（源泉徴収ナシ）を選ぶと、年間で２０万円を越える売却益が出ますと確定申告がひつようになります。証券会社から年間取引報告書はもらえますが税金は自分で確定申告をして納めなければなりません。
・一般口座は自分で損益を計算し、年間で２０万円を越える売却益が出た場合、年間取引報告書を作成し確定申告として税金を納めます。
ちなみに私は特定口座アリを選んでいます。
一般的に
・サラリーマンの人や会社にばれたくないという人
・収入が多くなると親の扶養に入っている方、夫の配偶者控除に入ってる主婦の方は所得税の優遇規定が適用されなくなる可能性が出てきますのでそれは困るので影響させたくないという人
・とにかく確定申告はやりたくない人
↑の人は特定口座(源泉徴収アリ）を選ぶと良いようです。
最終的なご判断は、ご自身の都合にあわせて選択いただきますようお願いいたします。
特定口座 ←詳しくはこちらを参考にどうぞ