腋窩部から腋臭臭、つまり、運動時などにかくエクリン腺からの汗の臭い（酸っぱい臭い、汗臭いと表現されることが多い）とは異なる特有の臭いがする。その臭い自体は人やその時の環境などによって違いがあるため一概には表現できないが、ネギの臭い、鉛筆の臭いに喩えられることが多い。この臭いはその形質を有する個人の属する集団の傾向によっては、しばしば他人に不快感を及ぼすものとして扱われる（腋臭症における問題点を参照）。さらに、その腋臭臭の原因となるアポクリン腺分泌物は衣服に黄色いしみを作り、汗が大量に出る多汗傾向を伴う。腋臭症の女性の一部には、性器や乳輪からも腋臭臭を認められる場合がある。その症状はすそわきがと呼ばれる。本形質による臭いを嫌うものの多い集団では、そこに属する腋臭症患者の多くがそれを過度に気にする精神状態に追い込まれ、結果として鬱病など併発する恐れがある。そのため、人間集団の傾向によっては腋臭症は軽視することはできない重要な健康問題となる