便秘と下痢をくりかえす場合、どちらの薬を飲むべきでしょうか？

まず基本的に下痢止めの使用はおすすめしません。

下痢を薬で止めてしまうと、排泄物が腸内に溜まってしまい、腸内環境が悪化します。

いまは下痢にも便秘にも効果のある整腸剤がありますので、これを継続して摂取して、腸内環境を整えてください。

また便秘と下痢をくりかえすのは精神的な原因も考えられますので、自律神経を整えることも必要です。