エクレアの起源についてははっきりしていないが、
19世紀初頭にフランスで生まれたことは知られている。
多くの料理史家はアントナン・カレームがエクレアを生み出したと推測している。
オックスフォード英語辞典では、
英語の語彙に初めてエクレアが現れた年を1861年としている。
現存するアメリカ合衆国初のエクレアのレシピは、
1884年に刊行されたD・A・リンカーン夫人によるボストン料理学校の料理書に含まれている。
米国の一部の地域では「ロング・ジョン」として知られている
バー状のドーナッツをエクレアとして販売しており、
メープルシロップ風味のものはメイプル・バー（maple bar）と呼ばれる例がある。
日本において、エクレアの知名度が高まったのは、
児童作家・大石真著の「チョコレート戦争」がきっかけであるという説もあるが、
エクレアの別表記であるエクレールは、
1927年（昭和2年）に西條八十が童謡「お菓子と娘」の中で取り上げ、
橋本国彦の曲によって人口に膾炙していたという事実もある。
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