腸管は、消化酵素により分解された栄養素が吸収される場所で、そして、分解された栄養素を利用して微生物が活発に増殖する場所です。
また、食物が有用化有害かを見極め、吸収または排除する重要な場所です。

つまり、食物抗原を上手に処理したり、病原微生物に対抗するために重要な演えき機構が腸管、特に小腸に備わっていると考えられています。

近年、このような働きに乳酸菌が大きな影響を与えることが明らかになっています。