海軍エンジニアのキナマンと娘のレイチェルの家が襲われた。キナマンはレイチェルを逃がすが撃たれてしまう。
リタがプライドの母親ミーナをプライドのバーに連れてきた。ミーナは懐かしい場所に帰ってこれたことを嬉しがるが、カシアスを恐れる。ミーナの記憶は混乱したままだった。
海軍エンジニアが負傷した事件のため、NCISが捜査にあたる。中にはキナマンだけではなく、娘のレイチェルもいたことがわかり、グレゴリオとカーターがキナマンの友人の警官と2階のレイチェルの部屋を調べる。部屋の窓にはしごがあり、レイチェルはそこから逃げたと思われた。部屋の写真からツリーハウスに逃げたと思われ、グレゴリオと警官がツリーハウスへ向かった。ツリーハウスに着くと警官がレイチェルに声をかけ、レイチェルが降りてくる。しかし、そこで犯人グループに襲われ、警官が射殺される。グレゴリオとレイチェルはレイチェルが調べていた廃工場へ逃げる。
レイチェルのノートパソコンを調べたパットンがレイチェルはいろいろなことを検索していたことを突き止める。
ハンナたちはツリーハウスを見つけるが、そこで警官の遺体を見つけるがグレゴリオたちはいない。カーターがグレゴリオの携帯を見つけた。プライドはカーターに廃工場の場所を教え、そこで合流することに。
グレゴリオたちのいる廃工場に犯人グループが入ってきた。グレゴリオが一人を倒すが、もう一人に追い詰められた。間一髪でプライドが犯人を倒した。
プライドはレイチェルをオフィスへ連れていく。パットンから来客を告げられプライドのオフィスへ行くとそこにはレッドことクラレンス・レティングが来ていた。カシアスに襲われた後、二度と戻るなと言われ、州境で解放されたという。プライドはレッドが生きていたことに喜んだ。
ロレッタから襲撃犯の身許がわかったと連絡があった。そこから、レイチェルが調べていたザイオン航空の保安主任と繋がりがあることがわかった。ザイオン航空は最近、重大事故が頻発していた。レイチェルはそのことを保安主任に連絡していた。ザイオン航空は投資家が手を引いた後にカルテルの隠れ蓑の投資会社が投資していた。このままだとFAA公認のカルテル系航空会社となってしまう。
レイチェルはキナマンを見舞いに行く前にハンナ、グレゴリオとともに家に寄る。しかし、ザイオン航空の保安主任が現れレイチェルとハンナに銃を向けた。レイチェルの部屋にいたグレゴリオが騒ぎに気付き窓のはしごを使い外に出て、保安主任の後ろに回り込み捕らえた。
事件後、プライドはミーナをレッドと再会させる。
天才的な検索能力をもつ自閉症？のレイチェルが知人の結婚式に向かうため父親のキナマンが取った航空機の会社を調べたら事故が頻発していて、裏ではカルテル系投資会社により乗っ取られようとしていたという話。
あと、まさかレッドが生きていて、プライドやミーナと再会するとは。また、ミーナ絡みではカシアスが別の妻との間にもうけたジミーにも会うシーンがあった。
現在、コロナの関係でNCISフランチャイズはすべて製作が中止され20話位で今シーズン終了ということで残り話数も少なくなってきたけど、ちゃんと終われるのかな？