BootCampを使用しているときにWindows7のみを再インストールする時ずいぶん悩みました。

MACが起動できなくなったらどうしよう。
MACがおかしくなったらどうしようと・・・・

しかし勇気を振り絞ってWindows7のインストールディスクを入れて再起動optionキーを押して再起動してwindows7のインストールDVDを指定してHDDのwindows7のパーティションをフォーマット
再インストール

無事に再インストールできました。MACもきちんと動きました。

MACには影響ないようです。

BootCampというものは
・パーディションを区切ってインストールをサポートする
・Windows用のドライバを用意する
だけのもので影響はないようです。