プロジェクト・ブルーブック（Project Blue Book）の下で空軍が分析した推定12,000件の報告のうち、約90%はでっち上げ（ホークス）や説明可能な自然・航空現象、あるいは天体現象とみなされた。残りの10%は、正真正銘のエイリアン（宇宙人）の目撃情報および/または事件とみなされた。しかしながら、すべてのUFO目撃情報や事件が空軍の「グラッジ（Grudge）」、「サイン（Sign）」、「ブルーブック」といったプロジェクトの下で報告されたわけではない。
1953年、プロジェクト・グリーム（Project Gleem）が独自の詳細な調査を開始し、一部の目撃情報は他のプロジェクトではなく、グリームの下で直接報告された。1966年に「プロジェクト・アクエリアス（Project AQUARIUS）」となったプロジェクト・グリームは、UFOの目撃情報や事件を扱う並行的な報告システムであった。
プロジェクト・アクエリアスの下で収集された報告は、エイリアンの宇宙船の実際の目撃情報、あるいはエイリアン生命体との実際の接触情報とみなされた。我々はニューメキシコ州から2隻のエイリアン宇宙船を回収した。2隻とも激しく損傷していたが、我々の科学者が調査することができた。その2隻の船は科学者たちから技術的偉業とみなされた。しかし、搭載されていた計器類があまりにも高度であったため、科学者たちはそれを解読することができなかった。2隻の船は西部にある特別なセキュリティ施設に保管された。我々はこれらの船から膨大な量の技術データを獲得した。
「プロジェクト・ブルーブック」の時代には、空軍およびCIAの要請により、複数の独立した科学調査が開始された。MJ-12は、空軍が公式にUFO目撃情報の調査を終了すべきだと決定した。この決定は1966年のNPNN会議において下された。理由は2つあった。第一に、米国がエイリアンとの通信を確立していたことである。
大統領： ちょっと待て、オーケー……いや、ビル、いいや……気にしないでくれ、続けてくれ。
WM・ケイシー： 大統領、通信プロジェクトはより上位のレベルのものです。この方針を継続し、時間があれば次の議題に移ることをお勧めします。
大統領： オーケー、ビル、君が船舵を握っているんだ。
ケアテイカー（管理役）： 米国は、エイリアンによる地球の探査が非攻撃的であり、敵対的ではないことを確信しておりました。また、エイリアンの存在が米国の安全保障を直接脅かすものではないことも確認されました。第二に、一般市民がUFOを実在するものだと信じ始めておりました。国家安全保障会議（NSC）は、この時期に関与していたエイリアンの訪問者に関する大規模な作戦の全貌を開示した場合、この世論が全国的なパニックにつながる恐れがあると判断しました。その作戦はさらに高度なレベルのものであり、今進めるか後回しにするかはケイシー長官に委ねられます。
WM・ケイシー： その部分については待ちましょう。私はまだ完全なブリーフィングを受けておらず、大統領にブリーフィングを行う前に、そのプログラムのすべてを把握しておきたいのです。
顧問1： ケイシー長官に同意します。そのプログラムの部分は非常に複雑であり、説明には丸一日必要となります。
大統領： オーケー、さっきも言ったように、この船の船長はビルだ。
ケアテイカー（管理役）： これらのプロジェクトが公に知られれば、米国の将来の宇宙計画が危機に瀕することになると考えられました。また、UFOやエイリアンの訪問に関する秘密を公開することは、世界中の宗教指導者たちの間にパニックを引き起こすことになります。したがって、MJ-12は世間の好奇心を満足させるために、UFO現象に関する独立した科学的研究が必要であると決定したのです。