通常は、ページにあるリンクをすべて取得してそれぞれのリンクに PageRank を渡します。もし無限に近いようなリンクがあったとしたら、渡される PageRank は、0.00000001 のようにほぼゼロに近いような値になります。
実際問題としては、2,000 〜 5,000 くらいの非常に多い上限をリンク数には設けていたと思われます。もっとも、こんなに多い数のリンクを 1 ページに設置しているサイトはほとんどないとも思いますが。
リンクの数を 100 以内だったか 200 以内に収めるようにヘルプ記事に文書化していましたが、許容する数が増えたので今は文書化はされてません。とはいえ、実際には、ユーザーが使えるような、常識的な範囲内の数にリンクは抑えたほうがいいでしょう。どのリンクを使ったらいいかユーザーはわからなくなりますから、数千のリンクを 1 ページに設置したりしないほうがいいのです。
HTML の上部にあるリンクが重要視されるかどうかに関しては、そんなことはありません。
そのページのコンテンツを取得してすべてのリンクをたどりますと。
HTML の最初にあるからといって、より重視するというようなことはありません。