2012/12/08追記
この情報は古い情報ですので、今はもっと簡単にできると思います。調べてないのであんまりわからないですが、こんな感じだったんだなー位で読んでください。
40秒着うた（着メロ）の作り方
① http://www.forest.impress.co.jp/lib/pic/music/soundedit/soundengine.html こういうものを使用し40秒以
下のファイルを作成
② iTunesに作成した音楽を登録し、編集→設定→一般タブ内のインポート設定→インポート方法をAACにする
③ iTunse上で登録したファイルを右クリックし、AACファイルを作成し、出来あがったものを右クリック→削除→
ゴミ箱
④ ゴミ箱からデスクトップ（どこでも大丈夫です）へ拾い上げ、○○○.m4aから○○○.m4rへ拡張子を変更
⑤ .ｍ4ｒに変更したファイルをダブルクリック
⑥ iTunseにiPhoneを接続しデバイスの着信音タブの着信音を同期にチェックを入れ、iTunseとiPhoneを同期
する
⑦ iPhoneの設定→着信音→作成した着うた（着メロ）にチェック（カスタム項目が出来ていれば成功）
終了
着うたフルの作り方（jailbreak済みiPhoneのみ）
① 40秒以下の着うたと同様、○○○.ｍ4ｒファイル作成
② iFunBox等でPCからiPhoneにアクセスし、Ringtonesフォルダを開き、そこへぶち込む
③ iphone再起動し、設定→サウンド→着信音 で選択
終了
おまけ
標準音邪魔だったのでRingtonesフォルダ内から削除したらこんなことに・・・。（バックアップはとってあります）
※自分用に書いてある事なので、これらを行ったことによる、PCの故障、iPhoneの故障、動作の保障等につきましては責任はとれません。全ては自己責任にてお願いいたします。