前半
- 1関ジャニ∞（5）
ズッコケ男道〜紅白で夢を歌おう〜 - 2PUFFY（初）
PUFFY 20周年紅白スペシャル - 3AAA（7）
ハリケーン・リリ、ボストン・マリ - 4E-girls（4）
DANCE WITH ME NOW! - 5欅坂46（初）
サイレントマジョリティー - 6三山ひろし（2）
四万十川〜けん玉大使編〜 - 7山内惠介（2）
流転の波止場〜究極の貴公子編〜 - 8ｍｉｗａ（4）
結 -ゆい- - 9Sexy Zone（4）
よびすて 紅白 ’16 - 10天童よしみ（21）
あんたの花道 - 11SEKAI NO OWARI（3）
Hey Ho from RPG - 12市川由紀乃（初）
心かさねて - 13三代目 J Soul Brothers（5）
Welcome to TOKYO - 14香西かおり（19）
すき〜真田丸スペシャルVer.〜 - 15椎名林檎（4）
青春の瞬き －FROM NEO TOKYO 2016－ - 16福田こうへい（3）
東京五輪音頭 - 17絢香（8）
三日月 - 18郷ひろみ（29）
言えないよ - 19Ｖ６（3）
Smile！メドレー - 20水森かおり（14）
越後水原〜白鳥飛翔〜 - 21いきものがかり（9）
SAKURA - 22ゆず（7）
見上げてごらん夜の星を 〜ぼくらのうた〜 - 企画「紅白 HALFTIME SHOW」渡辺直美・ピコ太郎
後半
- 23ＲＡＤＷＩＭＰＳ（初）
前前前世 [original ver.] - 24乃木坂46（2）
サヨナラの意味 - 25福山雅治（9）
2016スペシャルメドレー - 26島津亜矢（3）
川の流れのように - 27RADIO FISH（初）
PERFECT HUMAN - 28西野カナ（7）
Dear Bride - 29桐谷健太（初）
海の声〜みんなの海の声バージョン〜 - 30ＡＩ（2）
みんながみんな英雄 - 31AKB48（9）
夢の紅白選抜ＳＰメドレー - 32五木ひろし（46）
九頭竜川 - 33KinKi Kids（初）
硝子の少年 - 34Perfume（9）
FLASH - 35星野源（2）
恋 - 36大竹しのぶ（初）
愛の讃歌 - 37坂本冬美（28）
夜桜お七 - 38ＴＯＫＩＯ（23）
宙船（そらふね） - 39松田聖子（20）
薔薇のように咲いて 桜のように散って - 40X JAPAN（7）
紅 - 41髙橋真梨子（4）
ごめんね… - 42THE YELLOW MONKEY（初）
JAM - 43氷川きよし（17）
白雲の城 - 44宇多田ヒカル（初）
花束を君に - 45石川さゆり（39）
天城越え - 46嵐（8）
嵐×紅白スペシャルメドレー