seqkit使い方

infutfile.fasta中からAAA配列を検索

cat inputfile.fasta | seqkit grep -s -i -p AAA

配列が同じものを除いてmultifastaファイルを作成し、重複したサンプルのリストを作成する。

cat input.fasta | seqkit rmdup -s -o multi.fasta -d dup.fasta -D dup.txt

trash-cli

rmしたときにゴミ箱に捨てたものを一時退避

git clone https://github.com/andreafrancia/trash-cli

cd trash-cli

python setup.py install

~/.bashrcに以下を追記

if type trash-put &> /dev/null
then
    alias rm=trash-put
fi

ゴミ箱の中身表示

trash-list

ゴミ箱の中身を戻す 

trash-restore

ゴミ箱から消去

trash-rm file