2009年9月29日9時22分ごろ、東京都千代田区有楽町1丁目の東京メトロ千代田線日比谷駅で、「線路から煙のようなものが出ている」と駅員から通報があり、綾瀬方面に向かう10両編成の列車が一時停止した。東京消防庁などによると、列車の3~4両目の下部でポケットティッシュ1枚が燃えたという。27分に運転を再開したが、消防による検証のため33分から代々木上原―綾瀬間で上下線とも運転を停止し、同55分に運転再開した。この事故により21,600人に影響が出た。
2009年9月17日9時40分ごろ、JR南武線西国立駅で人身事故が発生した。この影響で、南武線は立川―稲 城長沼駅間の上下線で一時運転を見合わせたが、10時22分に運転を再開した。
2009年9月16日9時15分頃、東京都豊島区のJR山手線駒込駅で、ホームから男性が線路に飛び込み、進入してきた外回り電車(11両編成)にはねられた。
この事故で、外回り線が40分間運転を見合わせた。
この事故で、外回り線が40分間運転を見合わせた。
2009年9月16日11時45分ごろ、埼玉県蕨市中央1丁目のJR京浜東北線蕨駅で人身事故があり、同線は全線で運転を見合わせ、12時19分に再開した。