IE10/11環境で、既定のメールソフトにIBMのLotus Notesを使用すると、mailtoリンク押下時にブランクウィンドウが複数表示され、メールソフトが起動しないと言う問題が起こっているようです。
IBM公式
(参考) InternetExplorer10のインストール後にMailto が機能しない
IBM公式では、Lotus Notes9へアップデートすることで回避可能と言っていますが、Windowsのレジストリをいじることで、暫定対処出来る方法が見つかったので、ご紹介します。
(1) 編集対象のレジストリキー
"HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Classes\mailto"
(2) 上記(1)のレジストリキーに下記を追加。
URL Protocol(REG_SZ)
※値は空白値
regコマンドで設定する場合は下記のようなかんじ。
reg add "HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Classes\mailto" /v "URL Protocol" /t REG_SZ /d "" /f
※設定はコンピュータの管理者で実施する必要があります。