オリオンのﾌﾞﾛｸﾞ

初詣

初詣に行ってきました。1月11日の11時11分の時間に合わせて今日は、大安で一粒万倍の日何か始めるには最高の日となってます。次いでに、ワンワンワンで、犬の日。

今年のカード

あけましておめでとうございます今年もカードを引きました。神様カードから「たまのやのみこと」勾玉で、ございます。テーマとしては、磨く、物を大切にする、古いものを美しくですが、私のインスピレーションでは着飾る。物は、使ってこそ大切にしていると思うのです。自分を着飾るのは、宝石やファッションだけでなく自分自身を磨くのも着飾ることになるので何かに挑戦する年かもしれませんね。オシャレして出かけて知識を吸収しに行くかぁーもう一枚が、アトランティスカードから「サウンド　アンド　ミュージック」テーマは、調和私のインスピレーションは、ストレス解消と癒し声を出すことは、ストレス解消になります。たまには、大声で歌うのもいいもの、昨年は、カラオケ行ってない音楽は、心の癒しになりますよね。本当に好きな音楽は、瞑想にもなります。好きな音楽を聴きながら瞑想するといいもんです。今年も色んな感情を味わい、色んな経験をしたいと思います。

一年の感謝を込めて

一年の感謝を込めて、ご挨拶に行きました。日が変わると凄い人混みになるのでしょうね。では、みなさんに幸せかありますように。

メリークリスマス

キリスト生誕にこの曲は、どうかな？Let It Be 和訳When I find myself in times of trouble僕自身が窮地に陥ってしまったときMother Mary comes to meマリア様が僕のもとに現れてSpeaking words of wisdom賢者の言葉を伝えてくれた"Let it be"「あるがままに」And in my hour of darkness心が暗闇で覆われてしまったときShe is standing right in front of meマリア様はすぐそばにいてくれたSpeaking words of wisdomそして賢者の言葉を教えてくれたんだ"Let it be"「あるがままに」Let it be, let it be, let it be, let it beあるがままに、あるがままに、あるがままにしておけばいいWhisper words of wisdom賢者の囁きLet it beあるがままにAnd when the brokenhearted people世界中の傷ついた人たちはLiving in the world agree同じ気持ちだろうThere will be an answerきっと答えがあるはずだとLet it beあるがままにFor though they may be parted離れ離れになってしまったとしてもThere is still a chance that they will seeまたいつか出会える日が来るThere will be an answerそこに答えはあるのだからLet it beあるがままにLet it be, let it be, let it be, let it beあるがままに、あるがままに、あるがままにしておけばいいYeah there will be an answerそうさ、そこに答えはあるのだからLet it beあるがままにLet it be, let it be, let it be, let it beあるがままに、あるがままに、あるがままにしておけばいいWhisper words of wisdom賢者の囁きLet it beあるがままにLet it be, let it be, let it be, let it beあるがままに、あるがままに、あるがままにしておけばいいWhisper words of wisdom賢者の囁きLet it beあるがままにAnd when the night is cloudy夜が雲で覆われていてもThere is still a light that shines on me僕を照らす光はまだどこかにあるのだからShine until tomorrow明日が来るまで照らし続けてくれるLet it beあるがままにI wake up to the sound of music音楽が鳴って目を覚ますとMother Mary comes to meマリア様が僕の前に現れてSpeaking words of wisdom賢者の言葉を伝えてくれたLet it beあるがままにLet it be, let it be, let it be, let it beあるがままに、あるがままに、あるがままにしておけばいいThere will be an answerそこに答えはあるのだからLet it beあるがままにLet it be, let it be, let it be, let it beあるがままに、あるがままに、あるがままにしておけばいいWhisper words of wisdom賢者の囁きLet it beあるがままに

きたー

マイナス10頂きました。早くダイヤモンドダスト見たい。

最近の通勤風景

雪雪雪の毎日です。ホンダＺ前に乗っていたホンダＺがオーバーヒート気味でホンダに修理を依頼したら、エアーが噛んでいてエアー抜きをしたので大丈夫と言われたが、ものすごーく不安だったので中古車をネットで探していて休みの日によさげな中古車を見に行った先でオーバーヒートしました。テリオスキッドそこで、目星をつけていた中古車テリオスキッドを買うことになり納車の間は、代車を貸してくれることになり事なきことを得ました。11月28日に無事に納車されましたが、久しぶりのマニュアルいわゆる5ＭＴマニュアルです。エンストしまくりました(笑)京都ナンバーとも、さよならして札幌ナンバーとなりました。これで、私も道民(笑)燃費は、悪いけどフルタイム4ＷＤなので雪道は安心です。これからが、冬本番最近の通勤風景です。

イルミネーション

車が壊れて買い替えたりと忙しい11月でした。12月になり余裕ができたのでイルミネーションで気分転換してきました。

花火

円山

円山に登ってきました。と言っても200Ｍそこそこ我が家から歩いて40分未満運動がてらには丁度いい感じ。

岩見沢バラ園にて

岩見沢バラ園にローズフェスタに行ってきました。バラの香りが、園内一面に漂っていました。素晴らし花の香って、なんとも幸せを感じます。ただ咲いているだけで、人に幸せを与えてくれる。

夏越の大祓いby北海道神宮

夏越の大祓式に行ってきました。半年の穢れは落とせたかな。（穢れとは、気枯れ）帰りに水無月を食べようと思っていましたが残念ながら売り切れ(泣)まぁ糖分制限だからこれも戒め。

ベンチに座ると

散歩で、円山公園に行きベンチに座ると子狐が、近寄って来て私の前で座り込み

異端

グノーシス派と言われる文書です。キリスト教からすれば異端の内容ですが、そこに真実もあります。イエスは言われた。”過ぎ行く者たちのようになれ”。イエスは言われた。”［すべて］を知っていても、自己に欠ける者は、すべての所に欠けている”。イエスは言われた。”あなたがたがあなたがたの中にそれを生み出すならば、あなたがたが持っているものが、あなたがたを救うであろう。あなたがたがあなたがたの中にそれを持っていないならば、あなたがたがあなたがたの中に持っていないものが、あなたがたを殺すであろう”イエスは言われた。”私は彼らすべての上にある光である。私はすべてである。すべては私から出た。そして、すべては私に達した。木を割りなさい。私はそこにいる。石を持ち上げなさい。そうすればあなたがたは、私をそこに見出すであろう”https://www.youtube.com/watch?v=8ErkqKyRkfg

家の横の道で

今日、家の横の道で八重が満開近くになりました。京都の桜守で、佐野藤右衛門さんから聞いた話で「桜は、人が好きなんやそれで、人に見てもらうために下向きで花を咲かすんや」そんな話を思い出しました。

混雑してまぁ

人・人・人ですね。公園でＢＢＱ三昧。月あり・梅あり・桜ありそして雪もまだあります。

桜咲く

札幌もいよいよ春到来！日当たりの良いところは、7分咲きほど5本ほどしかないけど(笑)連休明けには、満開になるといいな。散歩コースの円山公園にて5月1日17時ごろ。

もう少しで・・・

運動もかねて、ウロウロ写歩。日中は、歩くと暖かいけど風は冷たいです。日中でも9度、明日からは、15度になるらしい。それでも朝晩は、暖房いります。今日見た感じでは、桜は5月に入ってからかな明日から暖かくなるから少し早まるといいけど。これは、道庁スバリ、ダイヤモンド道庁赤レンガビル前大通公園北海道神宮花見の為の露店です。後ろには、まだ雪が残ってます。桜はの蕾は、まだ青い。

春近し

札幌も雪解けで地面が現れてきました。ゴールデンウィークには、桜が見れそうです。待ち遠しい！平成29年4月5日撮影の伏見稲荷神社最近のお気に入りhttps://youtu.be/W7r-0w_4IKk

通勤風景

https://www.youtube.com/watch?v=BIAY_bJJYVY&t=1shttps://www.youtube.com/watch?v=wRnEc5lPfjo&t=136s

縄文人

https://www.soken.ac.jp/news/30232/https://www.soken.ac.jp/img/common/sp/logo_header01.pngMENUNEWS 最新情報・TOPICShttps://www.soken.ac.jp/img/common/ico_home01.pngNEWS 最新情報・トピックス 一覧【プレスリリース】『縄文人の核ゲノム配列をはじめて決定 〜東ユーラシア人の中で最初に分岐したのは縄文人だった〜』2016.09.01プレスリリース【プレスリリース】『縄文人の核ゲノム配列をはじめて決定 〜東ユーラシア人の中で最初に分岐したのは縄文人だった〜』https://www.soken.ac.jp/wordpress/wp-content/uploads/2015/11/logo_j-200x48.jpgプレスリリース概要『縄文人の核ゲノム配列をはじめて決定〜東ユーラシア人の中で最初に分岐したのは縄文人だった〜』【研究概要】国立遺伝学研究所集団遺伝研究部門および総合研究大学院大学遺伝学専攻の斎藤成也教授らのグループは、福島県北部にある三貫地貝塚から出土した縄文時代人（縄文人）の歯髄からDNAを抽出して、核ゲノムの一部を解読することに成功しました。これまで縄文人のＤＮＡについては、ミトコンドリアＤＮＡの情報しか得られていませんでした。今回、ミトコンドリアＤＮＡの数千倍にあたる核ゲノムのDNA配列1億1,500万塩基対を決定しました。このゲノム情報を、現代日本列島人と比較解析したところ、縄文人はアイヌ人にもっとも近く、ついでオキナワ人、そしてヤマト人（アイヌ人とオキナワ人を除く日本列島人）に近縁であることが明らかになりました。さらに、縄文人は、現代人の祖先がアフリカから東ユーラシア（東アジアと東南アジア）に移り住んだ頃、もっとも早く分岐した古い系統であること、そして、現代の本土日本人に伝えられた縄文人ゲノムの割合は15%程度であることが明らかになりました。今回、縄文人の核ゲノムの一部が解読されたことによって、縄文人が現代の東アジア人と比べて遺伝的に特異な集団であったことが明らかとなりました。今後、縄文人ゲノムデータを充実させ、それらを比較解析することによって、縄文人のたどった進化史が明らかになり、日本列島人の起源と成立を知ることにつながると期待されます。この研究成果は、Journal of Human Genetics（Online版）に掲載されます。【詳細研究内容】研究背景現代に生きる私達は、祖先から伝えられたＤＮＡを持っているので、現代人のＤＮＡを調べても過去の人々についてある程度推測することができます。しかし、過去に生きていた人々のＤＮＡを直接調べることができれば、これはすばらしい証拠になります。このようなＤＮＡを「古代ＤＮＡ」と呼びます。技術的な制約があるので、これまではもっぱらミトコンドリアＤＮＡの塩基配列を調べることが行なわれてきましたが、現在では、数万年以上前までさかのぼって、いろいろな年代に生きていた人々の骨や歯の中に微量に残っていたＤＮＡから、ミトコンドリアＤＮＡや核ゲノムのＤＮＡ配列が、次々に決定されています。日本では、1991年に国立遺伝学研究所の宝来聰らが、埼玉県で発見された縄文人の頭骨からミトコンドリアDNAを抽出し、塩基配列の一部分を決定したのがはじめての成果でした。その後、東京大学理学部の植田信太郎らが弥生人のミトコンドリアＤＮＡゲノムの塩基配列を一部分決定しました。縄文人については、国立科学博物館人類研究部の篠田謙一、山梨大学医学部の安達登、北海道大学理学部の増田隆一らが、関東、東北、北海道の各地で出土した縄文人の骨や歯からＤＮＡを抽出し、ミトコンドリアＤＮＡのハプロタイプを決定しました。斎藤研究室でも、総合研究大学院大学生命科学研究科遺伝学専攻の博士課程の学生だった神澤秀明（現在国立科学博物館人類研究部）が、古代ＤＮＡの解析を行ないました。福島県の北部海岸地方にある、約3000年前まで続いた三貫地貝塚から、1950年代に大量の人骨が発見され、それらが東京大学総合研究博物館に保管されています。これら縄文人４名の歯からＤＮＡを抽出し、その微量なＤＮＡからミトコンドリアＤＮＡの系統（ハプロタイプ）を推定しました。その結果、Ｎ９ｂとＭ７ａ２という、縄文人に高い頻度で見つかっている系統を、それぞれ２名ずつが持っていました（論文１に既発表）。私達は、福島県三貫地貝塚の縄文人から抽出したＤＮＡを用いて、次に核ＤＮＡのゲノム配列の一部分を決定しました。註：上の文章は『日本列島人の歴史』（斎藤成也著、2015年、岩波ジュニア新書）の一部をもとにした。研究結果・考察福島県三貫地貝塚の縄文人の大臼歯（奥歯）から抽出したＤＮＡの塩基配列を、次世代シークエンサーで大量に決定しました。コンピュータ解析により、その大部分はバクテリアなどヒト以外の配列でしたが、数％はヒト由来のものでした。これらヒト由来の塩基配列だけを以下の解析では用いました。古代ＤＮＡなので、200塩基弱と短く、大部分は40-180塩基の長さにおさまっています。また、古代ＤＮＡ特有の死後の塩基変化や、両端の塩基がプリンである場合なくなることを統計的にチェックして、たしかに大部分の塩基配列が古代ＤＮＡであろうと確認しました。一方、現代人のＤＮＡが混入しているかどうかを、ミトコンドリアＤＮＡの配列を大量に決定して調べたところ、サンプルＡ２の場合、現代人のＤＮＡが11%程度混入している可能性があったのに対して、他の２サンプル（A1とB）では6%以下の混入が予想されただけでした。これら２サンプルは異なる個体からのものですが、同一遺跡の同一時代（3000年前；炭素14年代推定による）から出土し、ミトコンドリアＤＮＡのハプロタイプも同一 (N9b)だったので、これら２サンプルの塩基配列を合体した1億1500万塩基を三貫地縄文人のデータとして、以下の解析に用いました。三貫地縄文人のゲノム塩基配列を現代人のゲノムデータと主成分分析法＊を用いて比較したところ、大きくアフリカ人、西ユーラシア人、東ユーラシア人にわかれるなかで、三貫地縄文人は東ユーラシア人にもっとも近く位置しました。そこで、三貫地縄文人と東ユーラシア人だけで比較したところ、図１のようになりました。ヤマト人（東京周辺に居住している日本人）が三貫地縄文人と北京周辺の中国人にはさまれた位置にあり、ヤマト人はこれら２集団のあいだの混血であることが示唆されます。https://www.soken.ac.jp/wordpress/wp-content/uploads/2016/07/press_image_20160825_1.png図１：三貫地縄文人（赤点）と他の人類集団ゲノムデータとの遺伝的近縁関係を主成分分析（PCA）でしめしたもの（今回の論文の Figure 1b）　クレジット：総研大・国立遺伝学研究所つぎに三貫地縄文人のゲノム塩基配列を東ユーラシアのさまざまな人類集団の全ゲノムＳＮＰデータと比較したところ、ここでもヤマト人は、縄文人と東アジア北方の集団との中間に位置していました。さらに、日本列島３集団および北京の中国人と比較した場合、第１主成分（全体の遺伝的多様性をもっとも大きく示す軸）では、三貫地縄文人はアイヌ人ともっと近く、そのあとはオキナワ人、ヤマト人、中国人（北京在住者）の順となります。一方第２主成分（全体の遺伝的多様性を二番目に大きく示す軸であり、第１主成分とは数学的に独立）でみると、三貫地縄文人はむしろオキナワ人やヤマト人に近くなっています。これは、アイヌ人がもっとも縄文人のゲノムを多く持っているが、おそらく北方人類集団との混血を経ており、オキナワ人はアイヌ人より縄文人のゲノムを少なく持っており、ヤマト人はさらに少ない割合だが、縄文人のゲノムがそれなりに伝わっていると推定したわれわれの以前の研究（論文２，論文３）と一致しています。次に、三貫地縄文人と対立遺伝子を共有している割合を、いろいろな集団で比較しました（図２）。第１主成分の結果と同様に、アイヌ人、オキナワ人、ヤマト人、中国人（北京在住）の順で三貫地縄文人との遺伝子の共有度が低くなっています。三貫地縄文人ともっとも遺伝子の共有度が高いのは日本人（ヤマト人）であり、他の東ユーラシア人は、北方でも南方でも同じ程度の共有度をしめしています。興味深いことに、南米先住民も他の東ユーラシア人とほぼ同程度となっていますが、オセアニア人は、もっと低い値です。https://www.soken.ac.jp/wordpress/wp-content/uploads/2016/08/press_image_20160825_2.png図２：三貫地縄文人と他の人類集団SNPデータとの対立遺伝子共有度をしめしたもの（今回の論文の Figure 3）クレジット：総研大・国立遺伝学研究所三貫地縄文人が現代人の進化的多様性の中でどこに位置するのかを推定するために、系統樹を作成しました（図３）。ここでは、東ユーラシアの現代人５集団、西ユーラシアの現代人５集団、パプアニューギニア人、南米先住民、アフリカの現代人２集団のほかに、シベリアの古代人２個体とデニソワ人も加えました。その結果、東ユーラシアの現代人５集団がひとつのグループにまとまり、それらの共通祖先集団と南米の先住民がまとまったあとに、三貫地縄文人、パプアニューギニア人、シベリアの古代人１がこの順でグループに加わっていました。これらの関係は、いずれも統計的に高い信頼性（ブーツストラップ確率＊）が与えられており、三貫地縄文人の祖先集団が、新大陸に人類が渡っていったとされる15000年ほど前よりも以前に分岐した、きわめて古い系統であることを物語っています。また、縄文人の系統からヤマト人（ＪＰＴ）への混血があったことも推定されました。https://www.soken.ac.jp/wordpress/wp-content/uploads/2016/07/press_image_20160825_3.png図３：三貫地縄文人と他の人類集団との系統樹 赤色数字は系統樹の枝の信頼性をしめすブーツストラップ確率を、矢印は混血をあらわす（今回の論文の Figure 4） クレジット：総研大・国立遺伝学研究所同様の系統関係は、混血を考えない系統樹でも示されました。また、混血の結果もある程度反映される系統ネットワークでも、線Ｘによって三貫地縄文人とヤマト人（ＪＰＴ）が多集団と分けられることから、両者のあいだに遺伝的な共通性があること、また線Ｙによって東ユーラシアの現代人５集団と南米先住民に遺伝的共通性があることが示されています。三貫地縄文人と他集団との混血については、別の方法でもっとくわしく解析し、現代日本人だけが混血したという結果を得ました。論文１：Kanzawa-Kiriyama H., Saso A., Suwa G., and Saitou N. (2013) Ancient mitochondrial DNA sequences of Jomon teeth samples from Sanganji, Tohoku district, japan. Anthropological Science, vol. 121, no. 2, pp. 89-103.論文２：Japanese Archipelago Human Population Genetics Consortium. (2012) The history of human populations in the Japanese Archipelago inferred from genome-wide SNP data with a special reference to the Ainu and the Ryukyuan populations. Journal of Human Genetics, Vol. 57, pp. 787–795.論文３：Jinam A. T., Kanzawa-Kiriyama H., Inoue I., Tokunaga K., Omoto K. & Saitou N. (2015) Unique characteristics of the Ainu population in Northern Japan. J. Hum. Genet. 60, 565–571 (2015).研究の発展性と波及効果今回発表される論文は、日本列島における古代人の核ゲノム塩基配列を決定した最初のものですが、すでに神澤らは他のいくつかの縄文時代の遺跡からの出土人骨からＤＮＡを抽出し、今回の三貫地貝塚縄文人から得られたゲノムＤＮＡ配列よりもはるかに多いゲノムＤＮＡ配列を得ています。このようなデータをもとにして、縄文人の日本列島における多様性と他の集団との系統関係・混血パターンがさらに明らかになってゆくことが期待されます。古代人は縄文人にはとどまらず、日本列島中央部でいえば、縄文時代より古い旧石器時代、弥生時代、古墳時代、それ以降の歴史時代に相当する時代についても、数多くの人骨が日本列島から発見されています。これら古代人のゲノム配列を決定することによって、日本列島およびその周辺において、人々が移動や混血を繰り返してきた有様が解明できると期待しています。【論文全著者】・Kanzawa-Kiriyama Hideaki神澤秀明（総研大遺伝学専攻　大学院生｛現在：国立科学博物館　研究員｝）・Kirill Kryukov (東海大学医学部ポストドク研究員)・Timothy A. Jinam (総研大遺伝学専攻　助教；国立遺伝学研究所集団遺伝研究部門　助教)・Hosomichi Kazuyoshi細道一善（総研大遺伝学専攻　助教；国立遺伝学研究所人類遺伝研究部門　助教 ｛現在：金沢大学金沢大学大学院医薬保健学総合研究科　准教授｝）・Saso Aiko 佐宗亜衣子（東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻　大学院生）・Suwa Gen 諏訪元（東京大学総合研究博物館　教授；東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻　教授）・Ueda Shintaroh 植田信太郎（東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻　教授）・Yoneda Minoru 米田穣（東京大学総合研究博物館　教授）・Tajima Atsushi 田嶋敦（金沢大学大学院医薬保健学総合研究科　教授）・Shinoda Ken-ichi 篠田謙一（国立科学博物館　副館長）・Inoue Ituro 井ノ上逸朗（総研大遺伝学専攻　教授；国立遺伝学研究所人類遺伝研究部門　教授）・Saitou Naruya 斎藤成也（総研大遺伝学専攻　教授；国立遺伝学研究所人類遺伝研究部門　教授；東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻　教授）【論文原題】A partial nuclear genome of the Jomons who lived 3,000 years ago in Fukushima, Japan【発表雑誌名】Journal of Human Genetics 2016年9月1日号【用語解説】主成分分析：統計学における多変量解析の手法のひとつ。多次元空間に位置する膨大なデータのしめすばらつきをもっとも適切に表現する軸を数学的にもとめて、それを第１主成分とし、それとは直交する（数学的に独立である）次の軸を第２主成分とする。データが多い場合、第３主成分，第４主成分、・・・と次々に計算されるが、人類集団の膨大なゲノムデータの場合、全体のばらつきを決めるのは集団の分化や混血パターンであり、それらが第１主成分と第２主成分で表現される平面の分布で表現される場合が多い。ブーツストラップ確率：現代統計学で広く使われているデータの信頼性を示す指標である。サンプルから重複を許したサンプリングをおこない、このような擬サンプルを多数生成させて、それらについて同一の手法（たとえば系統樹作成）で推定結果を得て、それぞれ推定された結果（系統樹の場合、枝別れパターン）の信頼性を、０〜１００％の値で示す。値が高いほうが信頼性が高い。https://www.soken.ac.jp/news/30232/Posted On 2016.09.01 By 広報社会連携室〒240-0193　神奈川県三浦郡葉山町（湘南国際村）PAGE TOPNEWS・最新情報・TOPICS各種申請手続ご意見・お問い合わせ研究者・職員募集調達情報大学概要入学案内教育・学生生活研究科・専攻特色ある活動広報・情報公開受験生の方へ在学生の方へ修了生の方へサイトマップ関連リンク本学のサイトについて国立大学法人　総合研究大学院大学（総研大）〒240-0193　神奈川県三浦郡葉山町（湘南国際村）TEL：046(858)1500(代表)　FAX：046(858)1542葉山キャンパスへのアクセスCopyright ©2014The Graduate University for Advanced Studies.All Rights Reserved.